W wyniku podziału spółki przez wydzielenie nie powstanie dochód z tytułu zmiany wartości składników majątku po stronie spółki dzielonej ani przejmującej, jeśli księgowe rozliczenie nastąpi metodą łączenia udziałów, eliminując tym samym przeszacowanie wartości składników do ich wartości rynkowej i wynikające z tego zobowiązania podatkowe.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę cywilną przed jej przekształceniem w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie stanowi dochodu podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek ani jako ukryty zysk, pod warunkiem właściwego udokumentowania ich pochodzenia i wcześniejszego opodatkowania.

Wydatki poniesione przez spółkę z tytułu użytkowania samochodów służbowych przez pracowników, będących poza gronem wspólników lub ich osób powiązanych, nie mogą być uznane za ukryte zyski ani za wydatki niezwiązane z działalnością gospodarczą zgodnie z art. 28m ust. 1 pkt 2 i 3 CIT.

Wpłaty na Państwowy Fundusz Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych dokonane przez spółkę, będące wynikiem struktury zatrudnienia, nie są wydatkami niezwiązanymi z działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 3 ustawy o CIT i w konsekwencji nie podlegają opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek.

Przychody z transakcji z podmiotem powiązanym, które generują wartość dodaną pod względem ekonomicznym, nie są uznawane za przychody bez wartości dodanej w kontekście art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. g ustawy o CIT; w efekcie zastosowanie estońskiego CIT jest możliwe.

Podatnik opodatkowany ryczałtem, spełniający wymogi z art. 28j CIT, kontynuuje opodatkowanie na kolejne okresy czteroletnie bez konieczności składania kolejnego ZAW-RD, o ile nie złoży rezygnacji.

Wypłaty czynszu najmu nieruchomości przez spółkę opodatkowaną estońskim CIT na rzecz podmiotu powiązanego, zawarte na warunkach rynkowych przed wyborem tego modelu, nie stanowią ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą w rozumieniu ustawy o CIT.

Podatnik rozpoczynający działalność gospodarczą, by korzystać z opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, w drugim i trzecim roku działalności winien jedynie zwiększyć zatrudnienie o co najmniej jeden etat rocznie bez konieczności spełnienia wymogu zatrudnienia przez 300 dni; pełny wymóg dotyczy dopiero czwartego roku działalności.

Opłaty z tytułu najmu lokalu użytkowego wypłacane przez Spółkę na rzecz wspólnika, realizowane na warunkach odpowiadających wartościom rynkowym i podyktowane rzeczywistymi potrzebami biznesowymi, nie stanowią dochodu z tytułu ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT.

Pomniejszenie zryczałtowanego podatku od dywidend, o którym mowa w art. 30a ust. 19 ustawy PIT, wymaga formalnego wyodrębnienia dochodów uzyskanych pod estońskim CIT w sprawozdaniu finansowym; brak takiego ujęcia wyklucza możliwość skorzystania z preferencji.

Sprzedaż lokalu niemieszkalnego przez spółkę, rozliczającą się ryczałtem od dochodów, na rzecz wspólnika pełniącego funkcję prezesa zarządu, przy wycenie ceny rynkowej przez niezależnego rzeczoznawcę, nie stanowi ukrytego zysku zgodnie z art. 28m ust. 3 ustawy o CIT.

Podział Spółki Dzielonej przez wydzielenie do podmiotu również opodatkowanego ryczałtem od dochodów spółek, nie skutkuje utratą prawa do ryczałtu ani obowiązkiem zapłaty podatku od zmiany wartości składników majątku.

Prowizje i odsetki wypłacane wspólnikom Spółki w okresie jej opodatkowania Estońskim CIT stanowią dochód z tytułu ukrytych zysków, podlegający opodatkowaniu ryczałtem, zgodnie z art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT, niezależnie od warunków rynkowych umów pożyczkowych.

Spółka z o.o., której udziałowiec pełni funkcje fundatora i członka zarządu fundacji, ma prawo do opodatkowania ryczałtem, o ile nie posiada on praw do świadczeń majątkowych jako fundator lub beneficjent, zgodnie z art. 28j ust. 1 pkt 4 ustawy o CIT.

Wpłaty na PFRON nie stanowią dochodu z wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą, gdyż nie mają charakteru sankcyjnego i są związane z funkcjonowaniem przedsiębiorstwa, a zatem nie wlicza się ich do dochodu opodatkowanego ryczałtem od dochodów spółek.

Członkostwo spółki z o.o. opodatkowanej estońskim CIT w spółdzielni energetycznej nie wyklucza z opodatkowania ryczałtem. Transakcje za energię pomiędzy spółką a spółdzielnią, realizowane po cenach rynkowych, nie są traktowane jako ukryte zyski podlegające dodatkowym obciążeniom podatkowym.

Wpłaty na Państwowy Fundusz Rehabilitacji Osób Niepełnosprawnych, dokonywane przez spółki objęte ryczałtem CIT, nie stanowią sankcyjnych wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą podatnika i nie są objęte opodatkowaniem ryczałtem od dochodów spółek.

Podatnik rozpoczynający działalność gospodarczą jest zwolniony z obowiązku spełnienia warunku zatrudnienia w pierwszym roku działalności oraz dwóch następnych latach, z zobowiązaniem do corocznego zwiększania zatrudnienia o pełen etat do osiągnięcia wymaganego przez ustawę poziomu zatrudnienia w czwartym roku opodatkowania ryczałtem.

Transakcje spółki z podmiotem powiązanym, w wyniku których generowana jest znacząca wartość dodana ekonomiczna, nie wykluczają możliwości opodatkowania ryczałtem, mimo że przychody z tych transakcji przekraczają 50% całkowitych przychodów spółki.

Podatnik, który na dzień zmiany formy opodatkowania zamyka księgi rachunkowe, nie kwalifikuje się jako 'podatnik rozpoczynający działalność' dla celów estońskiego CIT. Taka jednostka nie posiada prawa do preferencyjnych rozwiązań podatkowych związanych z ryczałtem od dochodów spółek, jeśli pierwszy rok podatkowy został zamknięty przed zmianą formy opodatkowania.

Nabycie obligacji skarbowych i korporacyjnych oraz korzystanie z usług zarządzania aktywami nie stanowi przesłanki do utraty prawa do opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek pod warunkiem spełnienia wszystkich kryteriów ustawowych określonych w art. 28j ustawy o CIT, przy czym nadmierny udział przychodów pasywnych może wykluczyć korzystanie z tej formy opodatkowania.

Wypłata zysków z jednoosobowej działalności gospodarczej wypracowanych przed przekształceniem w spółkę kapitałową, stanowi czynność neutralną podatkowo w kontekście podatku dochodowego od osób prawnych oraz ryczałtu od dochodów spółek, gdy zyski te były wcześniej opodatkowane PIT.

Zawarcie przez podatnika umowy deweloperskiej, samo w sobie, nie stanowi jeszcze wypłaty ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT. Ukryty zysk powstaje dopiero przy faktycznym przeniesieniu własności za cenę niższą niż rynkowa, co wiąże się z wykonaniem świadczenia i opodatkowaniem w ramach ryczałtu od dochodów spółek.