Podatnik opodatkowany Estońskim CIT, obowiązany do składania JPK_KR_PD, nie musi uzupełniać ksiąg o znaczniki podatkowe, ponieważ klasyfikacje te nie dotyczą rozliczeń w ramach Estońskiego CIT.

Koszty działalności badawczo-rozwojowej muszą być wyodrębniane w księgach rachunkowych zgodnie z art. 24a ust. 1b UPDOF, nawet jeśli nie podlegają rozliczeniu w uldze B+R. Wyodrębnienie obejmuje również wynagrodzenia pracowników związanych z działaniami B+R.

W przypadku gdy podatnik nie zamknie ksiąg rachunkowych oraz nie sporządzi sprawozdania finansowego na dzień poprzedzający przejście na opodatkowanie ryczałtem, wybór tej formy opodatkowania jest nieskuteczny, zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT.

Spółka z o.o. rozpoczyna działalność w dniu zawarcia umowy (powstania spółki w organizacji), a nie dopiero z dniem wpisu do KRS. Dla uzyskania statusu podatnika rozpoczynającego działalność niezbędne jest spełnienie warunków formalnych w tym potwierdzenia zamknięcia ksiąg na koniec poprzedniego okresu podatkowego przed obłożeniem opodatkowaniem ryczałtowym.

Podpisanie sprawozdania finansowego wyłącznie przez członków zarządu, bez podpisu osoby formalnie niepowołanej do księgowości, jest zgodne z przepisami ustawy o rachunkowości i nie wpływa na skuteczność wyboru estońskiego CIT, przy spełnieniu wszystkich pozostałych formalnych warunków.

Przejście praw i obowiązków podatkowych w przypadku łączenia się spółek przez przejęcie metodą łączenia udziałów, bez zamykania ksiąg rachunkowych, nie rodzi zobowiązania do złożenia zeznania podatkowego oraz przekazania ksiąg rachunkowych przez spółkę przejmowaną.

Podatnik CIT, nieprzekraczający równowartości 50 mln euro przychodów w poprzednim roku podatkowym i będący jednocześnie podatnikiem VAT przesyłającym JPK_VAT, obowiązany jest do przesłania plików JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2025 r.

Przejście na kwartalne rozliczanie VAT pozwala podatnikowi na przesunięcie obowiązku wysyłki elektronicznych ksiąg rachunkowych do organu podatkowego po raz pierwszy za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2026 r., zgodnie z przepisami przejściowymi ustawy o CIT oraz ustawy o VAT.

Podpisanie sprawozdania finansowego przez uprawnione osoby w terminie trzech miesięcy od dnia bilansowego jest warunkiem koniecznym do skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, gdyż potwierdza zgodność sprawozdania z wymaganiami ustawy o rachunkowości, co stanowi element konstytutywny dla prawomocności tego wyboru.

Sprawozdanie finansowe uważa się za prawidłowo sporządzone zgodnie z przepisami ustawy o rachunkowości, dopiero gdy zostanie podpisane przez wszystkie wymienione osoby w określonym terminie, czego brak uniemożliwia skuteczny wybór opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek.

Podatnik CIT, którego roczne przychody nie przekraczają równowartości 50 mln euro i który nie ma obowiązku przesyłania JPK_VAT, zobowiązany jest przesyłać JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2026 r.

W przypadku przekształcenia spółki niebędącej osobą prawną w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością stosującą opodatkowanie ryczałtem, przychody i koszty uzgadnia się na podstawie danych wynikających z ksiąg rachunkowych. Zobowiązanie podatkowe wygaśnie, jeśli ryczałt stosowany jest przez co najmniej cztery lata. (art. 7aa CIT)

Nieruchomość nabyta w celu jej późniejszej sprzedaży, która podlega znacznym przeróbkom, nie jest towarem handlowym, lecz produkcją niezakończoną. Wydatki związane z jej ulepszeniem powiększają wartość produkcji w toku i stają się kosztami uzyskania przychodu dopiero przy sprzedaży. Tymczasowe wynajęcie nie zmienia tej kwalifikacji, chyba że wynajem trwa ponad rok, czyniąc nieruchomość środkiem trwałym

Podatnik, który wykorzystał w pełni przyznany limit pomocy publicznej w ramach decyzji o wsparciu, przestaje osiągać dochody zwolnione z opodatkowania na jej podstawie, o ile decyzja nie wygeneruje nowych dochodów, może w tym samym roku kalendarzowym wybrać Estoński CIT.

Zamknięcie ksiąg rachunkowych oraz sporządzenie sprawozdania finansowego zgodnie z przepisami rachunkowości na dzień poprzedzający pierwszy miesiąc opodatkowania ryczałtem, z zachowaniem formy i terminu, spełnia warunki wyboru CIT estońskiego zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT.

Spółka, nie spełniając wymogów formalnych z art. 52 ustawy o rachunkowości dotyczących podpisania sprawozdania finansowego w terminie, nie nabyła prawa do opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek na 2024 r. Może jednak ubiegać się o tę formę opodatkowania w 2025 r., spełniając wszystkie ustawowe wymogi.

W przypadku wspólnego prowadzenia gospodarstwa rolnego objętego małżeńską wspólnością majątkową, każdemu z małżonków przysługuje obowiązek składania odrębnych deklaracji PIT-6 oraz stosowania indywidualnego limitu przychodów netto z ustawy o rachunkowości dla obowiązku prowadzenia ksiąg rachunkowych, co wynika z proporcjonalnego do udziałów opodatkowania dochodów.

Przy wyborze opodatkowania CIT estońskim, podatnik jest zobowiązany do wykazania różnic podatkowo-księgowych przed przejściem na ten system. Zobowiązanie podatkowe niewymagalne po 4-letnim nieprzerwanym okresie stosowania ryczałtu.

Przekształcenie jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę z o.o. skutkuje przypisaniem obowiązku prowadzenia ksiąg rachunkowych do spółki oraz umożliwia rozpoczęcie nowej działalności z prowadzeniem księgi przychodów i rozchodów oraz wyborem opodatkowania ryczałtem bez uwzględniania wcześniejszych przychodów.

Podatnicy prowadzący księgi rachunkowe niezgodnie z Międzynarodowymi Standardami sprawozdawczości finansowej są zobowiązani do uzupełniania ksiąg o znaczniki podatkowe zgodnie z § 2 ust. 1 pkt 3 Rozporządzenia JPK_CIT, nawet jeśli przepisy przejściowe z § 5 ust. 1 częściowo zwalniają z tego obowiązku.

Obowiązek prowadzenia i przesyłania ksiąg rachunkowych w formie elektronicznej dotyczy wyłącznie przychodów uzyskanych przez polski oddział zagranicznej spółki, a nie całości przychodów przedsiębiorstwa.

Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością powoduje kontynuację roku podatkowego spółki przekształcanej; zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się efektywna po zakończeniu kontynuowanego roku podatkowego.

Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie wymaga zamknięcia ksiąg rachunkowych podatkowo, a rok podatkowy przekształcanej spółki jest kontynuowany, zgodnie z postanowieniami ustawy CIT oraz zasadą sukcesji z Ordynacji Podatkowej.

W przypadku przekształcenia spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie ma obowiązku zamknięcia ksiąg rachunkowych, a rok podatkowy spółki przekształcanej jest kontynuowany przez spółkę przekształconą. Zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się możliwa po zakończeniu obecnego roku podatkowego.