W przypadku gdy podatnik nie zamknie ksiąg rachunkowych oraz nie sporządzi sprawozdania finansowego na dzień poprzedzający przejście na opodatkowanie ryczałtem, wybór tej formy opodatkowania jest nieskuteczny, zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT.
Spółka z o.o. rozpoczyna działalność w dniu zawarcia umowy (powstania spółki w organizacji), a nie dopiero z dniem wpisu do KRS. Dla uzyskania statusu podatnika rozpoczynającego działalność niezbędne jest spełnienie warunków formalnych w tym potwierdzenia zamknięcia ksiąg na koniec poprzedniego okresu podatkowego przed obłożeniem opodatkowaniem ryczałtowym.
Podpisanie sprawozdania finansowego wyłącznie przez członków zarządu, bez podpisu osoby formalnie niepowołanej do księgowości, jest zgodne z przepisami ustawy o rachunkowości i nie wpływa na skuteczność wyboru estońskiego CIT, przy spełnieniu wszystkich pozostałych formalnych warunków.
Przejście praw i obowiązków podatkowych w przypadku łączenia się spółek przez przejęcie metodą łączenia udziałów, bez zamykania ksiąg rachunkowych, nie rodzi zobowiązania do złożenia zeznania podatkowego oraz przekazania ksiąg rachunkowych przez spółkę przejmowaną.
Podatnik CIT, nieprzekraczający równowartości 50 mln euro przychodów w poprzednim roku podatkowym i będący jednocześnie podatnikiem VAT przesyłającym JPK_VAT, obowiązany jest do przesłania plików JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2025 r.
Podatnik opodatkowany ryczałtem od dochodów spółek nie przekracza limitu przychodu 50 mln euro, ustalonego zgodnie z przepisami rachunkowymi, w konsekwencji nie podlega obowiązkowi przesyłania ksiąg rachunkowych za rok obrotowy 2025 właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego.
Podpisanie sprawozdania finansowego przez uprawnione osoby w terminie trzech miesięcy od dnia bilansowego jest warunkiem koniecznym do skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, gdyż potwierdza zgodność sprawozdania z wymaganiami ustawy o rachunkowości, co stanowi element konstytutywny dla prawomocności tego wyboru.
Sprawozdanie finansowe uważa się za prawidłowo sporządzone zgodnie z przepisami ustawy o rachunkowości, dopiero gdy zostanie podpisane przez wszystkie wymienione osoby w określonym terminie, czego brak uniemożliwia skuteczny wybór opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek.
Podatnik, który jednorazowo przekroczy próg przychodu 50 mln euro w roku poprzednim, jest zobowiązany do przesyłania JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po dniu 31 grudnia 2024 r., niezależnie od incydentalnego charakteru transakcji powodującej przekroczenie progu.
W przypadku przekształcenia spółki niebędącej osobą prawną w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością stosującą opodatkowanie ryczałtem, przychody i koszty uzgadnia się na podstawie danych wynikających z ksiąg rachunkowych. Zobowiązanie podatkowe wygaśnie, jeśli ryczałt stosowany jest przez co najmniej cztery lata. (art. 7aa CIT)
Nie powstanie obowiązek prowadzenia i przesyłania ksiąg rachunkowych w formacie logicznym według art. 9 ust. 1c ustawy o CIT za 2025 rok, jeśli spółka przejmująca nie osiągnęła progu przychodów 50 mln euro w 2024 roku, mimo że spółki przejmowane ten próg przekroczyły.
Podatnik, który wykorzystał w pełni przyznany limit pomocy publicznej w ramach decyzji o wsparciu, przestaje osiągać dochody zwolnione z opodatkowania na jej podstawie, o ile decyzja nie wygeneruje nowych dochodów, może w tym samym roku kalendarzowym wybrać Estoński CIT.
Zamknięcie ksiąg rachunkowych oraz sporządzenie sprawozdania finansowego zgodnie z przepisami rachunkowości na dzień poprzedzający pierwszy miesiąc opodatkowania ryczałtem, z zachowaniem formy i terminu, spełnia warunki wyboru CIT estońskiego zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT.
Spółka, nie spełniając wymogów formalnych z art. 52 ustawy o rachunkowości dotyczących podpisania sprawozdania finansowego w terminie, nie nabyła prawa do opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek na 2024 r. Może jednak ubiegać się o tę formę opodatkowania w 2025 r., spełniając wszystkie ustawowe wymogi.
Podmiot zwolniony podatkowo na podstawie art. 6 ustawy o CIT korzysta ze zwolnienia z prowadzenia ksiąg w formie elektronicznej poza zakresem działalności gospodarczej. Przychody podlegające obowiązkowi prowadzenia ksiąg ustala się według wartości przychodów podatkowych.
Przy wyborze opodatkowania CIT estońskim, podatnik jest zobowiązany do wykazania różnic podatkowo-księgowych przed przejściem na ten system. Zobowiązanie podatkowe niewymagalne po 4-letnim nieprzerwanym okresie stosowania ryczałtu.
Obowiązek prowadzenia i przesyłania ksiąg rachunkowych w formie elektronicznej dotyczy wyłącznie przychodów uzyskanych przez polski oddział zagranicznej spółki, a nie całości przychodów przedsiębiorstwa.
Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością powoduje kontynuację roku podatkowego spółki przekształcanej; zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się efektywna po zakończeniu kontynuowanego roku podatkowego.
Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie wymaga zamknięcia ksiąg rachunkowych podatkowo, a rok podatkowy przekształcanej spółki jest kontynuowany, zgodnie z postanowieniami ustawy CIT oraz zasadą sukcesji z Ordynacji Podatkowej.
W przypadku przekształcenia spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie ma obowiązku zamknięcia ksiąg rachunkowych, a rok podatkowy spółki przekształcanej jest kontynuowany przez spółkę przekształconą. Zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się możliwa po zakończeniu obecnego roku podatkowego.
Kontynuacja roku podatkowego spółki przekształcanej w przypadku przekształcenia spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością jest prawidłowa, gdyż brak jest obowiązku zamknięcia ksiąg rachunkowych na potrzeby podatkowe, z uwagi na utrzymanie statusu podatnika CIT w obu formach spółek.
W przypadku wniesienia aportem zorganizowanej części przedsiębiorstwa brak zasady sukcesji podatkowej wyklucza możliwość kontynuatorstwa rozliczeń przez spółkę przyjmującą; spółka przyjmująca rozpoznaje przychody z tytułu wierzytelności przyjętych w drodze aportu zgodnie z wartością wynikającą z ksiąg podmiotu wnoszącego, a nie wartością emisyjną wydanych udziałów; brak prawa do zaliczenia spłaconych
Limit przychodów 50 mln euro dla JPK_KR odnosi się wyłącznie do przychodów polskiego oddziału, jednak limit 2 mln euro dla stawki 9% CIT powinien uwzględniać całkowite przychody przedsiębiorstwa, nie tylko te generowane przez oddział w Polsce.
Dochód z tytułu zbycia Białych Certyfikatów stanowi dochód z praw majątkowych zgodnie z art. 10 ust. 1 pkt 7 ustawy o PIT. Dochód z działów specjalnych produkcji rolnej może być ustalany na podstawie norm szacunkowych, jeżeli nie zostanie przekroczony próg przychodów nakładający obowiązek prowadzenia ksiąg rachunkowych.