Do skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek (estoński CIT) konieczne jest sporządzenie oraz prawidłowe podpisanie sprawozdania finansowego w ustawowym terminie. Późniejsze podpisanie sprawozdania uznawane jest za jego niesporządzenie zgodnie z wymogami ustawy o rachunkowości, co uniemożliwia wybór tej formy opodatkowania.

Podatniczka prowadząca podatkową księgę przychodów i rozchodów, przy sprzedaży ujmowanej w kasach fiskalnych, nie jest zobowiązana do ponownego księgowania faktur za sprzedaż, która była już zafiskalizowana.

W systemie estońskiego CIT, przy raportowaniu JPK_ST_KR, obowiązkiem podatnika jest wpisanie poprawnych wartości zgodnych z wytycznymi rozporządzenia Ministra Finansów dla określonych pól, gdzie nie można uznać wypełnienia wszystkich pozycji jako nieistniejących lub zerowych.

Złożenie zawiadomienia ZAW-RD bez uprzedniego podpisania sprawozdania finansowego zgodnie z ustawą o rachunkowości, uniemożliwia skuteczne wejście w reżim ryczałtu od dochodów spółek od 1 lutego 2024 r., a brak nowego zawiadomienia obejmującego właściwy okres uniemożliwia również wejście od 1 stycznia 2025 r.

W przypadku wyboru estońskiego CIT, terminowe podpisanie sprawozdania finansowego jest warunkiem skuteczności wyboru opodatkowania, stanowiąc integralną część jego merytorycznego sporządzenia.

Spółka przejmująca, nieprzekraczająca indywidualnego limitu przychodowego w roku poprzedzającym, nie jest zobowiązana do prowadzenia i przesyłania elektronicznych ksiąg rachunkowych na zasadach określonych w art. 9 ust. 1c ustawy o CIT z uwagi na przychody spółek przejmowanych jedynie, jeśli połączenie nastąpiło bez zamykania ksiąg rachunkowych.

Skuteczność wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek (estoński CIT) wymaga, aby sprawozdanie finansowe było sporządzone i podpisane zgodnie z ustawą o rachunkowości w terminie trzech miesięcy od dnia bilansowego, pod rygorem nieskuteczności wyboru tej formy opodatkowania.

Koszty działalności badawczo-rozwojowej muszą być wyodrębniane w księgach rachunkowych zgodnie z art. 24a ust. 1b UPDOF, nawet jeśli nie podlegają rozliczeniu w uldze B+R. Wyodrębnienie obejmuje również wynagrodzenia pracowników związanych z działaniami B+R.

W przypadku gdy podatnik nie zamknie ksiąg rachunkowych oraz nie sporządzi sprawozdania finansowego na dzień poprzedzający przejście na opodatkowanie ryczałtem, wybór tej formy opodatkowania jest nieskuteczny, zgodnie z art. 28j ust. 5 ustawy o CIT.

Spółka z o.o. rozpoczyna działalność w dniu zawarcia umowy (powstania spółki w organizacji), a nie dopiero z dniem wpisu do KRS. Dla uzyskania statusu podatnika rozpoczynającego działalność niezbędne jest spełnienie warunków formalnych w tym potwierdzenia zamknięcia ksiąg na koniec poprzedniego okresu podatkowego przed obłożeniem opodatkowaniem ryczałtowym.

Połączenie spółki z o.o. z inną spółką z o.o. przez przejęcie, jeżeli składniki majątku są przyjęte według wartości wynikających z ksiąg podatkowych oraz przypisane do działalności krajowej, nie powoduje powstania przychodu podlegającego opodatkowaniu, o którego mowa w art. 12 ust. 1 pkt 8c oraz 8d ustawy o CIT.

Podpisanie sprawozdania finansowego wyłącznie przez członków zarządu, bez podpisu osoby formalnie niepowołanej do księgowości, jest zgodne z przepisami ustawy o rachunkowości i nie wpływa na skuteczność wyboru estońskiego CIT, przy spełnieniu wszystkich pozostałych formalnych warunków.

Przejście praw i obowiązków podatkowych w przypadku łączenia się spółek przez przejęcie metodą łączenia udziałów, bez zamykania ksiąg rachunkowych, nie rodzi zobowiązania do złożenia zeznania podatkowego oraz przekazania ksiąg rachunkowych przez spółkę przejmowaną.

Podatnik CIT, nieprzekraczający równowartości 50 mln euro przychodów w poprzednim roku podatkowym i będący jednocześnie podatnikiem VAT przesyłającym JPK_VAT, obowiązany jest do przesłania plików JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2025 r.

Podatnik opodatkowany ryczałtem od dochodów spółek nie przekracza limitu przychodu 50 mln euro, ustalonego zgodnie z przepisami rachunkowymi, w konsekwencji nie podlega obowiązkowi przesyłania ksiąg rachunkowych za rok obrotowy 2025 właściwemu naczelnikowi urzędu skarbowego.

Przejście na kwartalne rozliczanie VAT pozwala podatnikowi na przesunięcie obowiązku wysyłki elektronicznych ksiąg rachunkowych do organu podatkowego po raz pierwszy za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2026 r., zgodnie z przepisami przejściowymi ustawy o CIT oraz ustawy o VAT.

Podpisanie sprawozdania finansowego przez uprawnione osoby w terminie trzech miesięcy od dnia bilansowego jest warunkiem koniecznym do skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, gdyż potwierdza zgodność sprawozdania z wymaganiami ustawy o rachunkowości, co stanowi element konstytutywny dla prawomocności tego wyboru.

Sprawozdanie finansowe uważa się za prawidłowo sporządzone zgodnie z przepisami ustawy o rachunkowości, dopiero gdy zostanie podpisane przez wszystkie wymienione osoby w określonym terminie, czego brak uniemożliwia skuteczny wybór opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek.

Podatnik CIT, którego roczne przychody nie przekraczają równowartości 50 mln euro i który nie ma obowiązku przesyłania JPK_VAT, zobowiązany jest przesyłać JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po 31 grudnia 2026 r.

Podatnik, który jednorazowo przekroczy próg przychodu 50 mln euro w roku poprzednim, jest zobowiązany do przesyłania JPK_CIT za rok podatkowy rozpoczynający się po dniu 31 grudnia 2024 r., niezależnie od incydentalnego charakteru transakcji powodującej przekroczenie progu.

W przypadku przekształcenia spółki niebędącej osobą prawną w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością stosującą opodatkowanie ryczałtem, przychody i koszty uzgadnia się na podstawie danych wynikających z ksiąg rachunkowych. Zobowiązanie podatkowe wygaśnie, jeśli ryczałt stosowany jest przez co najmniej cztery lata. (art. 7aa CIT)

Nie powstanie obowiązek prowadzenia i przesyłania ksiąg rachunkowych w formacie logicznym według art. 9 ust. 1c ustawy o CIT za 2025 rok, jeśli spółka przejmująca nie osiągnęła progu przychodów 50 mln euro w 2024 roku, mimo że spółki przejmowane ten próg przekroczyły.

Nieruchomość nabyta w celu jej późniejszej sprzedaży, która podlega znacznym przeróbkom, nie jest towarem handlowym, lecz produkcją niezakończoną. Wydatki związane z jej ulepszeniem powiększają wartość produkcji w toku i stają się kosztami uzyskania przychodu dopiero przy sprzedaży. Tymczasowe wynajęcie nie zmienia tej kwalifikacji, chyba że wynajem trwa ponad rok, czyniąc nieruchomość środkiem trwałym

Podatnik, który wykorzystał w pełni przyznany limit pomocy publicznej w ramach decyzji o wsparciu, przestaje osiągać dochody zwolnione z opodatkowania na jej podstawie, o ile decyzja nie wygeneruje nowych dochodów, może w tym samym roku kalendarzowym wybrać Estoński CIT.