W podziale przez wydzielenie zorganizowanej części przedsiębiorstwa sukcesja z art. 93c Ordynacji podatkowej obejmuje wyłącznie nieskonkretyzowane na dzień wydzielenia prawa i obowiązki w VAT związane z wydzielanym majątkiem; rozliczenia, których przesłanki powstały przed tym dniem, obciążają spółkę dzieloną, a powstałe w dniu podziału lub później — spółkę przejmującą.
Korektę faktury in minus należy uznać za uprawnioną, gdy wystąpią zdarzenia zmieniające pierwotną wartość transakcji, a jej wystawienie musi być udokumentowane potwierdzonym odbiorem przez nabywcę; obniżenia podstawy dokonuje się w okresie otrzymania potwierdzenia, a nie samego wystawienia faktury korygującej.
Korekty podatku naliczonego VAT w przypadku zaliczek niewróconych przez dostawcę dokonuje się dopiero z chwilą zwrotu tej zaliczki nabywcy, niezależnie od wcześniejszego wystawienia faktury korygującej.
Podstawa opodatkowania przy sprzedaży regenerowanych części samochodowych obejmuje pełną wartość towaru, w tym Rdzenia, który podlega zwrotowi, a fakt zwrotu skutkuje obniżeniem podstawy opodatkowania poprzez wystawienie faktury korygującej. Rozliczenia te należy dokonywać za okres wystawienia faktury korygującej w postaci faktury ustrukturyzowanej.
Jeżeli korekta "in plus" wynika z okoliczności, które pojawiają się po wystawieniu pierwotnej faktury, to zgodnie z art. 29a ust. 17 ustawy o VAT, zmiana podstawy opodatkowania powinna być ujmowana za okres, w którym wystąpiła ta okoliczność, tj. w momencie zawarcia aneksu podnoszącego wynagrodzenie. Opodatkowanie wsteczne nie jest wymagane.
Korekta rozliczeń dokonana z podmiotem powiązanym, której celem jest dostosowanie rentowności do polityki cen transferowych, lecz nie wpływa na ceny jednostkowe usług świadczonych w roku rozliczeniowym, znajduje się poza zakresem opodatkowania VAT i nie wymaga dokumentacji fakturą VAT.
Spółka Przejmująca, jako następca prawny w wyniku sukcesji generalnej częściowej, jest uprawniona do odliczenia VAT naliczonego z ustrukturyzowanych faktur korygujących in plus wystawionych po Dniu podziału, na mocy art. 93c Ordynacji podatkowej.
Korektę kosztów uzyskania przychodów wynikającą z różnic w składkach ubezpieczeniowych należnych po zakończeniu okresu ubezpieczenia, które nie są wynikiem błędów rachunkowych ani oczywistej omyłki, należy rozpoznać na bieżąco w momencie otrzymania faktury dokumentującej przyczyny korekty, zgodnie z art. 15 ust. 4i ustawy o CIT.
W przypadku otrzymania przedpłaty przed dostawą towaru, podatnik ma obowiązek wystawić fakturę VAT zgodnie z art. 106i ust. 2 ustawy o VAT, niezależnie od późniejszych losów zamówienia. Ponadto, obniżenie podstawy opodatkowania powinno mieć miejsce w rozliczeniu za okres, w którym wystawiono fakturę korygującą.
Potwierdzeniem otrzymania faktury korygującej przez nabywcę, w kontekście obniżenia podstawy opodatkowania, jest skuteczne umożliwienie zapoznania się z fakturą poprzez jej zamieszczenie w systemach teleinformatycznych, przy spełnieniu warunków należytej staranności, w tym nieotrzymaniu informacji o niedoręczeniu wiadomości e-mail (brak komunikatu "Bounce").
Faktura korygująca in minus powinna być uwzględniona w rozliczeniu VAT za okres jej otrzymania przez podatnika, podczas gdy faktura korygująca in plus za okres rozliczeniowy, w którym ustalono zmianę ceny i wystawiono fakturę korygującą w KSeF.
Nie jest dopuszczalne wskazywanie referencji do faktur pierwotnych wyłącznie w zewnętrznym załączniku poza KSeF dla spełnienia obowiązków informacyjnych na fakturze korygującej, zgodnie z art. 106j ustawy o VAT.
Faktura korygująca wystawiona w następnym roku podatkowym, niebędąca wynikiem błędu rachunkowego lub oczywistej omyłki, wpływa na przychody w okresie jej wystawienia, a nie w roku rozliczeniowym, którego dotyczyły pierwotne faktury ryczałtowe.
W przypadku rabatów cenowych dokumentowanych fakturami korygującymi, które nie wynikają z błędów rachunkowych ani oczywistych omyłek, korekta przychodów powinna być dokonana w okresie rozliczeniowym wystawienia faktury korygującej, zgodnie z art. 12 ust. 3j ustawy o CIT.
Otrzymanie faktury zakupowej poza KSeF, mimo obowiązku wystawienia jej w formie ustrukturyzowanej, nie wyklucza prawa do odliczenia VAT naliczonego pod warunkiem, że faktura spełnia inne wymagania formalne i materialne oraz występuje związek nabycia z czynnościami opodatkowanymi.
Podatnik VAT ma prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur wystawionych i doręczonych poza Krajowym Systemem e-Faktur, pod warunkiem spełnienia pozostałych przesłanek materialnych, nawet gdy faktury te powinny być wystawione w systemie KSeF.
Przedsiębiorstwo w spadku, kontynuując działalność zmarłego przedsiębiorcy, ma prawo odliczać VAT z faktur wystawionych na zmarłego oraz dokonywać korekt podatkowych za okres przed powołaniem zarządu sukcesyjnego, z zachowaniem zasady pełnej kontynuacji rozliczeń podatkowych.
Faktura zaliczkowa może stanowić podstawę do wygenerowania e-DD w ramach zwolnienia od akcyzy, jeżeli do momentu generowania e-DD Spółka nie dysponuje innymi dokumentami. W przypadku różnic ilościowych, przekraczających wartość wskazaną na fakturze zaliczkowej, konieczne jest wystawienie faktury korygującej i wygenerowanie odpowiedniego e-DD dla dodatkowej ilości. Taki e-DD musi być wystawiony w ustawowym
Generowanie e-DD przez podmioty dokonujące sprzedaży wyrobów węglowych zwolnionych z akcyzy powinno opierać się na najbardziej aktualnej fakturze dokumentującej sprzedaż, tj. fakturze korygującej, jeśli została wystawiona przed generowaniem e-DD, a w przypadku późniejszych korekt, konieczne jest nowelizowanie e-DD.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT naliczonego z faktur zakupowych wystawionych poza systemem KSeF, o ile spełnione są materialne przesłanki transakcji podlegającej opodatkowaniu; faktury te są uważane za otrzymane w momencie rzeczywistego ich otrzymania, niezależnie od późniejszego przesłania w systemie KSeF.
Czynnym podatnikom VAT przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych wystawionych poza Krajowym Systemem e-Faktur, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT, o ile spełnione są pozostałe, materialne przesłanki prawa do odliczenia. Wystawienie faktury poza KSeF, mimo obowiązku, nie stanowi przesłanki negatywnej wskazanej w art. 88 ustawy.
W przypadku opóźnionego ogłoszenia wskaźników GUS, zmiany cen usług budowlanych powinny być rozliczone w VAT poprzez wystawienie faktury pierwotnej z wstępnym wskaźnikiem i korygującej po publikacji finalnego wskaźnika, rozliczając korektę "in plus" na bieżąco w momencie zaistnienia przyczyny.
Podatnik nie może odliczać całości podatku naliczonego z faktur, które nie uwzględniają znanych mu rabatów w momencie otrzymania. Obowiązek korekty odliczenia powstaje w momencie otrzymania faktury korygującej dokumentującej rabat, a nie w okresie jej otrzymania.