Na podstawie art. 6 ust. 1 pkt 5 ustawy zmieniającej przychód akcjonariusza z likwidacji SKA pomniejsza się o rzeczywiście poniesione wydatki na nabycie lub objęcie akcji. Przy akcjach kupionych jest to cena zapłacona zbywcy, a przy akcjach objętych za wkład niepieniężny – faktyczne nakłady na nabycie lub wytworzenie przedmiotu aportu, nie zaś jego wartość ustalona dla potrzeb objęcia akcji.

Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością będąca następcą prawnym spółki komandytowo-akcyjnej, wypłacając byłemu komplementariuszowi zysk wypracowany przez spółkę przekształcaną w okresie jej opodatkowania CIT, pobiera 19% zryczałtowany PIT jako płatnik, z zastosowaniem pomniejszenia określonego w art. 30a ust. 6a–6c ustawy o PIT, jeżeli wypłacony zysk jest identyfikowalny co do roku jego osiągnięcia

Sprzedaż wyodrębnionego organizacyjnie, finansowo i funkcjonalnie segmentu działalności usługowej, obejmującego niezbędne zasoby pracownicze, składniki majątkowe, dokumentację oraz prawa i obowiązki kontraktowe, stanowi zbycie zorganizowanej części przedsiębiorstwa w rozumieniu art. 2 pkt 27e ustawy o VAT, wyłączone z opodatkowania na mocy art. 6 pkt 1 tej ustawy; nabywcy nie przysługuje z tego tytułu

Spółka komandytowo-akcyjna, jako spółka kapitałowa w świetle Dyrektywy 2008/7/WE i orzecznictwa TSUE, korzysta ze zwolnienia z podatku od czynności cywilnoprawnych przy pożyczkach udzielanych przez wspólników na podstawie art. 9 pkt 10 lit. i) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.

Komplementariusz spółki komandytowo-akcyjnej może odliczyć od dochodu opodatkowanego podatkiem dochodowym od osób fizycznych zapłacone składki na własne ubezpieczenia społeczne, nie związane bezpośrednio z wynagrodzeniem za prowadzenie spraw spółki, jeżeli spełniają warunki z art. 26 ust. 1 pkt 2 lit. a ustawy o PIT.

Spółka komandytowo-akcyjna, wypłacając zaliczki na zyski komplementariuszom, jest zobowiązana do poboru zryczałtowanego podatku dochodowego dopiero po ustaleniu podatku CIT należnego od dochodu za cały rok podatkowy, gdyż tylko wtedy możliwe jest prawidłowe obliczenie podatku według zasad określonych w ustawie o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Wniesienie wkładów niepieniężnych do spółki komandytowo-akcyjnej, objęte VAT, nie podlega opodatkowaniu PCC jako zmiana umowy spółki, zgodnie z dyrektywą 2008/7/WE i utrwaloną linią orzeczniczą sądów administracyjnych oraz TSUE.

Wniesienie aportu przez komandytariusza w formie certyfikatów ETF do spółki komandytowej nie powoduje powstania przychodów podlegających opodatkowaniu podatkiem CIT; za koszt uzyskania przychodów przy sprzedaży tych certyfikatów uznaje się ich wartość rynkową ustaloną na dzień aportu. (art. 12 ust. 4 pkt 4 i art. 15 ust. 1 w zw. z art. 16 ust. 1 pkt 8 ustawy o CIT)

Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie skutkuje dla wspólników powstaniem przychodu, a w efekcie nie rodzi zobowiązania podatkowego w podatku dochodowym od osób fizycznych.

Podstawą opodatkowania podatkiem od czynności cywilnoprawnych w przypadku podwyższenia kapitału zakładowego w spółce komandytowo-akcyjnej jest suma, o którą podwyższono kapitał zakładowy, przy czym agio emisyjne nie podlega opodatkowaniu, a obowiązek podatkowy powstaje z chwilą zmiany umowy spółki.

Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością, które nie skutkuje podwyższeniem kapitału zakładowego ponad wcześniej opodatkowaną wartość wkładów, nie kreuje zobowiązania podatkowego ze względu na zastosowanie zwolnienia, mimo iż powoduje powstanie obowiązku podatkowego.

Pożyczka udzielona spółce komandytowo-akcyjnej przez jej wspólnika nie może korzystać ze zwolnienia z podatku przewidzianego dla spółek kapitałowych w art. 9 pkt 10 lit. i) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych. W świetle prawa krajowego, spółka ta traktowana jest jako osobowa, co wyłącza możliwość stosowania przedmiotowego zwolnienia.

Pożyczka udzielona przez akcjonariusza spółce komandytowo-akcyjnej kwalifikowanej jako spółka kapitałowa podlega zwolnieniu z podatku od czynności cywilnoprawnych na podstawie art. 9 pkt 10 lit. i) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.

Wynagrodzenie Komplementariusza za prowadzenie spraw Spółki oraz świadczenia niepieniężne stanowi ukryty zysk podlegający opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek, gdyż związane jest z prawem do udziału w zysku zgodnie z art. 28m ust. 3 ustawy o CIT.

Wypłaty na rzecz wspólników spółki komandytowej lub komandytowo-akcyjnej z tytułu zobowiązania długoterminowego, powstałego w wyniku przekształcenia i przeksięgowania kapitału zapasowego, nie podlegają dodatkowi podatkowemu, gdyż wcześniej opodatkowane zyski nie stanowią nowego przychodu podatkowego.

Kontynuacja roku podatkowego spółki przekształcanej w przypadku przekształcenia spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością jest prawidłowa, gdyż brak jest obowiązku zamknięcia ksiąg rachunkowych na potrzeby podatkowe, z uwagi na utrzymanie statusu podatnika CIT w obu formach spółek.

Koszty uzyskania przychodu w przypadku obniżenia udziału kapitałowego w spółce komandytowo-akcyjnej ustala się na podstawie wartości bilansowej majątku spółki z o.o. na moment jej przekształcenia, zgodnie z art. 23 ust. 1 pkt 38 ustawy o PIT, przy uwzględnieniu sukcesji uniwersalnej między spółkami.

Spółka komandytowo-akcyjna dokonująca wypłat zaliczek na poczet zysku na rzecz komplementariusza będącego osobą fizyczną, jest zobowiązana do bieżącego poboru zryczałtowanego podatku dochodowego od każdej takiej wypłaty, niezależnie od finalnego rozliczenia rocznego podatku spółki.

Możliwość odliczenia zapłaconych składek na ubezpieczenie społeczne i zdrowotne jako koszty uzyskania przychodu od przychodu osiągniętego z tytułu prowadzenia spraw spółki komandytowo-akcyjnej.

Uznanie czy spółka komandytowo-akcyjna będzie uprawniona do opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek od 1 stycznia 2025 r.

Powstanie przychodu w związku z planowanym połączeniem spółek.

Przepis określający zwolnienie od podatku dotyczący udzielania pożyczek przez wspólnika spółce kapitałowej, nie może mieć zastosowania do umowy spółki komandytowo-akcyjnej i jej zmiany. W związku z tym w opisanej sytuacji nie ma zastosowania zwolnienie określone w art. 9 pkt 10 lit. i) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.

Przepis określający zwolnienie od podatku dotyczący udzielania pożyczek przez wspólnika spółce kapitałowej, nie może mieć zastosowania do umowy spółki komandytowo-akcyjnej i jej zmiany. W związku z tym w opisanej sytuacji nie ma zastosowania zwolnienie określone w art. 9 pkt 10 lit. i) ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.

Obowiązki płatnika odnośnie wypłaty zaliczek na poczet zysku komplementariusza.