W podziale przez wydzielenie zorganizowanej części przedsiębiorstwa sukcesja z art. 93c Ordynacji podatkowej obejmuje wyłącznie nieskonkretyzowane na dzień wydzielenia prawa i obowiązki w VAT związane z wydzielanym majątkiem; rozliczenia, których przesłanki powstały przed tym dniem, obciążają spółkę dzieloną, a powstałe w dniu podziału lub później — spółkę przejmującą.

Podmiotowi, który formalnie zgłasza import towarów, ale nie uwzględnia kosztów tych towarów w cenie świadczonych opodatkowanych usług, nie przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego z tytułu importu, zgodnie z zasadami określonymi w art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.

Gmina może stosować indywidualny prewspółczynnik oparty na kryterium ilościowym wykorzystania infrastruktury wodno-kanalizacyjnej do celów gospodarczych, zapewniający rzetelne odliczenie podatku naliczonego, zgodnie ze specyfiką prowadzonej działalności, gdy wzór z Rozporządzenia MF nie odpowiada jej specyfice działalności.

Podatnik zwolniony z VAT, który nie wykonuje czynności opodatkowanych, nie ma prawa do odliczenia podatku VAT należnego z tytułu importu usług, gdyż możliwość taka jest zastrzeżona dla czynnych podatników realizujących czynności opodatkowane.

Podatnik, który ponosi wydatki związane z realizacją projektu mającego służyć zarówno czynnościom opodatkowanym, jak i zwolnionym z VAT, bez możliwości odrębnego przyporządkowania podatku naliczonego, powinien stosować proporcjonalne odliczenie VAT, zgodnie z art. 90 ustawy o VAT.

Podmiot nie będący czynnym podatnikiem VAT oraz nie wykonujący czynności opodatkowanych, ani wykorzystujący towarów i usług do czynności opodatkowanych, nie ma prawa do obniżenia kwoty podatku należnego o kwotę podatku naliczonego ani do odzyskania VAT.

Gmina nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego od wydatków poniesionych na inwestycję w budynki użyteczności publicznej, gdyż nie są one wykorzystywane do czynności opodatkowanych, a jedynie do realizacji zadań własnych Gminy wyłączonych z opodatkowania.

Gmina ma prawo do proporcjonalnego odliczenia podatku naliczonego VAT od wydatków związanych z infrastrukturą wodno-kanalizacyjną przy zastosowaniu metody kalkulacji prewspółczynnika opartej na stosunku ilości metrów sześciennych wody i ścieków do odbiorców zewnętrznych względem ogółu tej liczby, co dokładnie odzwierciedla specyfikę wykonywanych przez nią czynności.

Usługa przyłączenia do sieci wod-kan realizowana przez gminę za odpłatnością stanowi czynność opodatkowaną podatkiem VAT. Gminie przysługuje prawo do pełnego odliczenia VAT od wydatków inwestycyjnych związanych z tymi usługami, o ile spełnione są przesłanki art. 86 ustawy o VAT.

Gminie nie przysługuje prawo do obniżenia podatku należnego o podatek naliczony z faktur dotyczących wydatków na inwestycję służącą zadaniom własnym, gdyż nie pełni funkcji podatnika w ramach działalności opodatkowanej.

Jednostki samorządu terytorialnego, realizujące inwestycje związane zarówno z działalnością gospodarczą, jak i niezwiązaną z nią, uprawnione są do częściowego odliczenia podatku naliczonego VAT, przy zastosowaniu preproporcji zgodnej z art. 86 ust. 2a oraz proporcji sprzedaży według art. 90 ust. 3 ustawy o VAT.

Wniesienie aportem infrastruktury nie stanowi transakcji zbycia przedsiębiorstwa ani zorganizowanej części przedsiębiorstwa i podlega opodatkowaniu VAT jako odpłatna dostawa towarów. Podstawą opodatkowania jest wartość netto składników majątkowych powiększona o VAT należny. Gminie przysługuje pełne odliczenie podatku naliczonego związanego z Inwestycją I-II.

Podatnik importujący towary na terenie RP w celu wykonania na nich usług integracyjnych ma prawo do odliczenia podatku naliczonego z tytułu importu, nawet gdy nie jest właścicielem towarów, o ile koszty związane z importem są integralną częścią świadczonych opodatkowanych usług.

Jednostka samorządu terytorialnego, w ramach specyficznej działalności wodociągowej, może stosować pre-współczynnik metrażowy dla określenia proporcji odliczenia VAT, jeśli dokładnie odzwierciedla on zakres działalności gospodarczej podlegającej opodatkowaniu.

Gmina, realizując projekt geodezyjny nie będący działalnością opodatkowaną VAT, nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego z faktur za towary i usługi związane z tym projektem. Działając jako organ władzy publicznej, Gmina wykonuje tu zadania publicznoprawne, które nie uprawniają do odliczenia VAT.

Gminie, jako zarejestrowanemu czynnemu podatnikowi VAT, przysługuje prawo do pełnego odliczenia podatku naliczonego związanego z inwestycją w infrastrukturę wodociągową, która po odpłatnej dzierżawie stanowić będzie czynność opodatkowaną na zasadach ogólnych.

Gmina nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego od wydatków poniesionych na realizację inwestycji, która nie generuje czynności opodatkowanych, zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.

Świadczenie usług dostarczania wody i odprowadzania ścieków przez gminę stanowi działalność gospodarczą podlegającą VAT bez zwolnienia. Gmina ma prawo do proporcjonalnego odliczenia podatku naliczonego, przy czym odliczenie może opierać się o kalkulację metrażu zużytej wody i odprowadzonych ścieków jako klucza proporcji odpowiedniejszego niż regulacje formalne.

Miasto, jako podatnik VAT, nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego od wydatków projektowych termomodernizacji budynków użyteczności publicznej, jeśli inwestycje nie służą czynnościom opodatkowanym VAT. Wyjątek stanowią wydatki na instalację fotowoltaiczną, które mogą być odliczone, jeśli służą dostawie energii podlegającej opodatkowaniu.

Prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego przysługuje podatnikowi wyłącznie w zakresie, w jakim wydatki są związane z działalnością opodatkowaną podatkiem VAT, przy czym czynności realizujące zadania własne gminy zgodnie z u.s.g., jeżeli nie są związane z działalnością opodatkowaną, wykluczają możliwość dokonania odliczenia.