Wydatki na nabycie i naprawy części zamiennych oraz części zamiennych wchodzących w skład pakietów naprawczych, traktowane jako koszty pośrednie, są potrącalne w dacie ich poniesienia, tj. w dniu ujęcia w księgach rachunkowych, niezależnie od ich bilansowego rozliczenia i momentu faktycznego zużycia.

Zgodnie z art. 14 ust. 4 umowy między Polską a Czechami, wynagrodzenie czeskiego rezydenta podatkowego, uzyskiwane za pracę na pokładzie pojazdu kolejowego w transporcie międzynarodowym, podlega opodatkowaniu wyłącznie w Czechach, niezależnie od liczby dni spędzonych w Polsce.

Opodatkowanie kwot otrzymanych w wyniku zawarcia ugody.

uregulowania dotyczące transportu w cysternach kolejowych alkoholu etylowego (liczenia dnia wysłania i przyjęcia za dzień przewozu dla celów obliczenia maksymalnych norm ubytków)

VAT - w zakresie opodatkowania właściwą stawką podatku opłat manipulacyjnych pobieranych z tytułu sprzedaży biletów kolejowych na trasy krajowe i międzynarodowe.