Jeżeli do wartości początkowej środka trwałego wchodzą wydatki na usługi niematerialne od podmiotów powiązanych objęte ograniczeniem w zaliczaniu do kosztów podatkowych, to ograniczenie to będzie miało zastosowanie do odpisów amortyzacyjnych dokonywanych od tego środka trwałego. Takie niekorzystne dla podatników stanowisko zajął Dyrektor Krajowej Informacji Skarbowej w interpretacji, której fragment

Od 1 stycznia 2018 r. podatnicy będą mogli zaliczyć do kosztów podatkowych tylko część kosztów tzw. usług niematerialnych, takich przykładowo jak usługi doradcze, konsultingowe kontrolne czy badawcze. Limit obejmie koszty tego rodzaju usług poniesione na rzecz podmiotów powiązanych lub podmiotów z krajów stosujących szkodliwą konkurencję podatkową. Wprowadzone regulacje mają zapobiec sztucznemu generowaniu