Przychody i koszty w spółce cichej powinny być rozliczane proporcjonalnie do udziału w zyskach zgodnie z art. 8 u.p.d.o.f., a przekazanie wkładu przez wspólnika cichego nie generuje przychodu podatkowego u wspólnika jawnego. Zyski można dzielić już przy zaliczkach na podatek.

Podział przez wydzielenie działalności holdingowo-inwestycyjnej do spółki przejmującej, przy spełnieniu kryteriów zorganizowanej części przedsiębiorstwa, jest neutralny podatkowo na moment podziału. Przychód po stronie wspólników spółki dzielonej nie wystąpi, a wpływy z wydzielonego majątku będą opodatkowane dopiero w przypadku zbycia nowo otrzymanych udziałów.

Dobrowolne umorzenie udziałów wspólnika spółki z ograniczoną odpowiedzialnością bez wynagrodzenia nie skutkuje powstaniem przychodu podlegającego opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych dla wspólników, którzy nie uczestniczyli w umorzeniu.

Odstąpienie przez jednego wspólnika spółki cywilnej od żądania zwrotu nakładów stanowi dla drugiego wspólnika przychód podatkowy z działalności gospodarczej w rozumieniu art. 14 ust. 2 pkt 6 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Zyski wypracowane przez spółkę komandytową przed wyborem estońskiego CIT, prawidłowo wyodrębnione i opodatkowane za wcześniejszy okres, nie podlegają ponownemu opodatkowaniu ryczałtem przy ich wypłacie wspólnikom.

Podział przez wydzielenie działalności XYZ z X sp. z o.o., tworzący dwie zorganizowane części przedsiębiorstwa, nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego dla spółki dzielonej, przy czym przychód wspólnika Y podlega opodatkowaniu w Polsce zgodnie z ustawą o CIT i Konwencją PL-NL.

Wypłata zaliczek na poczet udziału w zysku przez spółkę komandytową skutkuje obowiązkiem poboru zryczałtowanego podatku dochodowego przez spółkę jako płatnika, zgodnie z art. 41 ust. 4e w związku z art. 30a ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT, pomimo późniejszej możliwości pomniejszenia kwoty podatku.

Przeniesienie praw udziałowych w zamian za umorzenie udziałów wspólnika, traktowane jako świadczenie niepieniężne, skutkuje rozpoznaniem przychodu podatkowego po stronie dłużnika na podstawie art. 14a ust. 1 ustawy o CIT, obejmującym regulację zobowiązania w postaci umorzenia udziałów.

Wycofanie działki z majątku spółki jawnej na rzecz wspólników, jako czynność nieodpłatna i niezwiązana z prawem do odliczenia VAT, nie stanowi odpłatnej dostawy towarów w rozumieniu art. 7 ust. 2 ustawy o VAT i tym samym nie podlega opodatkowaniu podatkiem VAT.

Podział spółki przez wydzielenie zorganizowanej części przedsiębiorstwa, kiedy majątki zarówno pozostający, jak i przenoszony stanowią zorganizowane części przedsiębiorstwa, jest neutralny podatkowo na gruncie ustawy o PIT, co zwalnia spółkę dzieloną z roli płatnika podatku dochodowego.

W przypadku nieprzedłożenia formularza CIT-15J przez spółkę jawną przed rozpoczęciem roku obrotowego, przy braku wyłączności osób fizycznych jako wspólników, spółka traci status transparentności podatkowej i w konsekwencji uzyskuje status podatnika podatku dochodowego od osób prawnych, zgodnie z art. 1 ust. 3 pkt 1a ustawy o CIT.

Spółka jawna nie złożywszy informacji CIT-15J przed rokiem obrotowym, której wspólnikami nie są wyłącznie osoby fizyczne, uzyskuje status podatnika podatku dochodowego od osób prawnych od początku tego roku, zgodnie z art. 1 ust. 3 pkt 1a ustawy CIT.

Przekształcenie spółki komandytowej, której wspólnikami są wyłącznie osoby fizyczne, w spółkę jawną nie generuje dochodu do opodatkowania CIT po stronie przekształcanej spółki; powstała z przekształcenia spółka jawna zachowuje status podmiotu podatkowo transparentnego (art. 93a Ordynacji podatkowej).

Spółka jawna, której wspólnikami są osoby prawne, celem zachowania statusu podmiotu transparentnego, zobowiązana jest do corocznego składania informacji CIT-15J przed rozpoczęciem roku obrotowego. Niezłożenie tej informacji skutkuje uznaniem spółki za podatnika CIT od początku roku obrotowego.

Czynność nieodpłatnego wycofania nieruchomości z majątku spółki jawnej do majątków osobistych wspólników, w proporcjach odpowiadających ich udziałom w zyskach, nie podlega opodatkowaniu podatkiem od spadków i darowizn, gdyż nie spełnia definicji darowizny ani nieodpłatnego zniesienia współwłasności zgodnie z ustawą.

Umowa nienazwana o nieodpłatne przeniesienie nieruchomości ze spółki jawnej do wspólników, nie stanowi czynności cywilnoprawnej podlegającej opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, gdyż nie mieści się w katalogu zawartym w art. 1 ust. 1 pkt 1 ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych.

Częściowe wycofanie wkładu przez wspólnika ze spółki komandytowej, po uzyskaniu przez nią statusu podatnika CIT, skutkuje powstaniem przychodu z kapitałów pieniężnych, podlegającego opodatkowaniu 19% stawką. Nie stanowi ono przychodu z pozarolniczej działalności gospodarczej.

Pożyczki udzielane spółce komandytowej przez jej wspólnika są na gruncie ustawy o podatku od czynności cywilnoprawnych traktowane jako zmiana umowy spółki i opodatkowane bez względu na powiązania z podatkiem VAT, z obowiązkiem składania deklaracji PCC-3 i wpłaty podatku.

Zwroty środków otrzymywane od wspólnika na pokrycie zapłaconych przez spółkę podatków i odsetek za zwłokę nie stanowią przychodu podatkowego dla spółki w świetle art. 12 ust. 4 pkt 6a ustawy o CIT, ponieważ nie powiększają definitywnie jej aktywów.

Przychód z tytułu sprzedaży nieruchomości, będącej środkiem trwałym wykorzystywanym w działalności gospodarczej, która jest zbywana po upływie pięciu lat od jej nabycia, nie stanowi przychodu podlegającego opodatkowaniu podatkiem dochodowym, jeśli nieruchomość ma charakter mieszkalny.

Przychody i koszty związane ze świadczeniami otrzymanymi przez spółkę przed wyborem opodatkowania ryczałtem, podlegają wstępnej korekcie według art. 7aa ustawy o PDOP, o ile występuje różnica czasowa lub nie zostały wcześniej ujęte podatkowo. Umorzone subwencje nie podlegają tej korekcie przy braku różnic czasowych.

Czynsz najmu za nieruchomość, niebędący efektem działań między podmiotami powiązanymi wywierających wpływ na decyzje spółki, ustalony na warunkach rynkowych i niezależny od zysków spółki, nie stanowi ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 3 pkt 3 ustawy o CIT i nie podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek.

Wynagrodzenie za umorzenie udziałów, finansowane zarówno z zysku ryczałtowego, jak i z kapitału zapasowego pochodzącego z agio, stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków i podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek na podstawie art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT.