Przekształcenie spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością powoduje kontynuację roku podatkowego spółki przekształcanej; zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się efektywna po zakończeniu kontynuowanego roku podatkowego.
Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie wymaga zamknięcia ksiąg rachunkowych podatkowo, a rok podatkowy przekształcanej spółki jest kontynuowany, zgodnie z postanowieniami ustawy CIT oraz zasadą sukcesji z Ordynacji Podatkowej.
W przypadku przekształcenia spółki komandytowo-akcyjnej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie ma obowiązku zamknięcia ksiąg rachunkowych, a rok podatkowy spółki przekształcanej jest kontynuowany przez spółkę przekształconą. Zmiana roku podatkowego na kalendarzowy staje się możliwa po zakończeniu obecnego roku podatkowego.
Wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej do majątku wspólników na podstawie umowy nienazwanej nie skutkuje powstaniem obowiązku podatkowego w podatku od spadków i darowizn, jako że czynność ta nie wypełnia warunków umowy darowizny ani nieodpłatnego zniesienia współwłasności.
Sprzedaż niezabudowanych działek numer A/31 i B/41, jako terenów budowlanych, podlega opodatkowaniu podatkiem VAT i wyklucza zastosowanie zwolnienia wskazanego w art. 43 ust. 1 pkt 9 w związku z art. 2 pkt 33 ustawy o VAT.
Nieodpłatne wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej na rzecz wspólników, proporcjonalnie do udziałów w zysku, nie podlega podatkowi od czynności cywilnoprawnych, jako że czynność ta nie została wymieniona w zamkniętym katalogu czynności podlegających temu podatkowi.
Nieodpłatne przekazanie nieruchomości ze spółki komandytowej do majątku prywatnego wspólników, na mocy uchwały, jako czynność nienazwana, nie wywołuje skutku podatkowego w zakresie podatku od spadków i darowizn, gdy nie przyjmuje formy umowy darowizny ani nieodpłatnego zniesienia współwłasności.
Nieodpłatne przeniesienie własności nieruchomości z majątku spółki komandytowej na wspólników, proporcjonalnie do ich udziałów w zysku, nie stanowi czynności cywilnoprawnej podlegającej opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych, z uwagi na brak uwzględnienia tej czynności w zamkniętym katalogu czynności wymienionych w ustawie.
Spółka komandytowa, wypłacając komplementariuszom zaliczki na poczet zysków podczas roku podatkowego, nie jest zobowiązana do poboru zryczałtowanego podatku dochodowego od osób fizycznych (art. 41 ust. 4e ustawy o PIT) przed obliczeniem ostatecznego podatku należnego za rok podatkowy, z którego zysk został uzyskany.
Nieodpłatne przekazanie nieruchomości ze spółki komandytowej do majątku wspólników, stanowi przychód z kapitałów pieniężnych, podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych, na zasadach przewidzianych dla przychodów z udziału w zyskach osób prawnych.
Wycofanie nieruchomości z majątku spółki komandytowej i jej nieodpłatne przekazanie wspólnikom skutkuje powstaniem przychodu podatkowego z kapitałów pieniężnych, podlegającego opodatkowaniu na gruncie podatku dochodowego od osób fizycznych, z uwagi na zachowanie odrębności majątkowej spółki i wspólników.
Spółka komandytowa, dokonując w trakcie roku podatkowego wypłat zaliczek na poczet udziału w zysku komplementariuszom, nie jest zobowiązana do pobierania zryczałtowanego podatku dochodowego, ze względu na brak konkretnego zobowiązania podatkowego przed zakończeniem roku podatkowego.
Płatności dokonywane na rzecz niemieckiej spółki komandytowej z przypisaniem ich luksemburskiemu wspólnikowi korzystają z ochrony Konwencji PL-LUX, zatem nie wymagają poboru podatku u źródła w Polsce, o ile spełnione są wszelkie wymagania dokumentacyjne dotyczące rezydencji podatkowej.
Wypłacając zaliczki na poczet zysku komplementariuszom w trakcie roku podatkowego, spółka nie ma obowiązku pobierania od nich zryczałtowanego podatku dochodowego, co następuje dopiero po obliczeniu rocznego podatku CIT spółki.
Limit przychodów w wysokości 2 000 000 euro, określony w art. 6 ust. 4 pkt 1 lit. b) ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym od niektórych przychodów, odnosi się wyłącznie do przychodów wspólników uzyskanych po przekształceniu spółki komandytowej w spółkę jawną.
Obowiązek podatkowy komplementariusza spółki komandytowej z tytułu przychodów z udziału w zyskach nie powstaje w momencie wypłaty zaliczek, lecz w momencie uchwały o podziale zysku. Płatnik podatku jest zobowiązany do poboru z uwzględnieniem zasad rozliczenia podatku CIT spółki, zgodnie z art. 30a ust. 6a-6e u.p.d.o.f.
Dochód komplementariusza ze zmniejszenia wkładu kapitałowego w spółce komandytowej oblicza się jako przychód pomniejszony o koszty historyczne związane z uzyskanie praw spółki cywilnej. Podatek oblicza się tylko od dochodu, w przypadku jego powstania, a spółka komandytowa pełni funkcję płatnika podatku.
Wypłaty zysków przed uzyskaniem statusu podatnika CIT są neutralne podatkowo, natomiast wypłaty po tej dacie generują podlegający opodatkowaniu przychód; obniżenie wkładów powoduje powstanie przychodu z kapitałów pieniężnych, zmniejszanego o historyczne wydatki na nabycie udziałów.
Komplementariusz spółki komandytowej może pomniejszyć należny zryczałtowany podatek dochodowy od zysków o proporcjonalnie przypadającą część podatku CIT zapłaconego przez spółkę, a pobranie zaliczek tego podatku powinno nastąpić dopiero po zamknięciu roku podatkowego i ustaleniu ostatecznego wyniku podatkowego spółki.
Wypłata komandytariuszom zysków spółki komandytowej, wypracowanych i opodatkowanych przed dniem uzyskania przez spółkę statusu podatnika CIT, nie powoduje obowiązku poboru podatku PIT przez spółkę jako płatnika.
Zryczałtowany podatek dochodowy od zaliczek na poczet zysku komplementariusza w spółce komandytowej nie powinien być pobierany przez płatnika w trakcie roku podatkowego. Pobranie i rozliczenie tego podatku następuje dopiero po złożeniu rocznego zeznania CIT-8, co zapewnia zgodność z ustawą i zapobiega podwójnemu opodatkowaniu.
Koszty uzyskania przychodów z tytułu datio in solutum obejmują wydatki odpowiadające wartości nominalnej wkładu, z wyłączeniem agio; stanowią one koszty podatkowe wyłącznie w ramach odpłatnego zbycia udziałów, zgodnie z regulacjami ustawy o CIT.
Do kosztów podatkowych z tytułu przeniesienia udziałów w drodze datio in solutum nie stosuje się zasad wymiany udziałów, gdy podmiot nie był podatnikiem CIT podczas nabycia tych udziałów. Wydatki na nabycie uznaje się według wartości nominalnej udziałów przydzielonych za wkład niepieniężny.
Przekształcenie spółki komandytowej w spółkę z ograniczoną odpowiedzialnością nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego dla wspólników na gruncie ustawy PIT, ponieważ jest neutralne podatkowo z uwagi na sukcesję uniwersalną i brak zwiększenia wartości wkładów majątkowych.