Pożyczka udzielona przez spółkę, opodatkowaną ryczałtem od dochodów spółek, swojemu udziałowcowi stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków, chyba że spełnia określone warunki zwolnienia z ryczałtu. Intencja legislacyjna zakłada, że pożyczki dla udziałowców są opodatkowane ryczałtem, niezależnie od celów ich przeznaczenia.

Wynagrodzenie z tytułu dzierżawy nieruchomości oraz nakładów na nieruchomości stanowi dochód z ukrytych zysków podlegający opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek, zgodnie z art. 28m ust. 3 ustawy o CIT.

Po spełnieniu warunków z art. 28j ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT, transakcje z podmiotami powiązanymi, generujące wartość dodaną większą niż znikomą, pozwalają na wybór ryczałtu od dochodów spółek jako formy opodatkowania, nawet przy dominującej sprzedaży na rzecz podmiotu powiązanego.

Opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek podlega wynagrodzenie wypłacone z kapitału zapasowego za umorzenie udziałów, niezależnie od tego, czy pochodzi z zysków osiągniętych przed okresem opodatkowania ryczałtem, jako dochód z tytułu ukrytych zysków, zgodnie z art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT.

Po przekształceniu spółki cywilnej w spółkę z o.o., w razie wcześniejszego wyczerpania dopuszczalnej pomocy regionalnej, spółka z o.o. może natychmiast skorzystać z opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, o ile spełnia resztę wymogów art. 28j Ustawy o CIT.

Zaliczenie wypłat na poczet zysków wspólników spółki z o.o. do opodatkowania ryczałtem według stawki 10% przewidzianej dla małych podatników jest prawidłowe pod warunkiem posiadania statusu małego podatnika na dzień wypłaty środków, a obowiązek zapłaty ryczałtu powstaje do końca trzeciego miesiąca roku podatkowego po roku, w którym dokonano wypłaty.

Wydatki poniesione na pojazdy wykorzystywane mieszanie przez wspólników, niezależnie od momentu ich zakupu lub amortyzacji, mogą stanowić ukryte zyski w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT i podlegają opodatkowaniu według szczególnych zasad Ryczałtu.

Przychody z transakcji z podmiotem powiązanym, które generują wartość dodaną większą niż znikoma, spełniają warunki opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek zgodnie z art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. g ustawy o CIT.

Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością, która spełnia przesłanki określone w art. 28j ust. 1 ustawy o CIT, zachowuje prawo do ryczałtu od dochodów spółek mimo zmiany składu wspólników, pod warunkiem, że udziałowcami pozostają jedynie osoby fizyczne.

Spółka, jako mały podatnik, może stosować obniżoną stawkę ryczałtu w wysokości 10% w drugim roku podatkowym dla dochodu z podzielonego zysku i ukrytych zysków. W trzecim roku podatkowym, utrata statusu małego podatnika skutkuje podwyższeniem stawki do 20%. Rok podjęcia uchwały o podziale zysku determinuje wysokość stawki ryczałtu, niezależnie od roku wypracowania zysku.

Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością może stosować ryczałt od dochodów spółek, gdy jej jedyny wspólnik będący fundatorem fundacji nie posiada praw majątkowych związanych z otrzymywaniem świadczeń z fundacji, zgodnie z wykładnią art. 28j ust. 1 pkt 4 CIT.

Czynsz za wynajem nieruchomości płacony przez spółkę od podmiotu powiązanego nie stanowi ukrytego zysku ani wydatku niezwiązanego z działalnością gospodarczą w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT, pod warunkiem że transakcja ta obiektywnie odpowiada wartości rynkowej.

Posiadanie przez spółkę statusu fundatora fundacji oraz otrzymywanie pomocy w ramach realizacji celów statutowych tejże fundacji nie wyklucza możliwości stosowania ryczałtowego opodatkowania od dochodów spółek, pod warunkiem, że spółka i jej wspólnicy nie posiadają praw majątkowych jako fundatorzy lub beneficjenci fundacji.

Czynsz za najem nieruchomości przez spółkę estońską, zawarty na rynkowych zasadach, nie stanowi ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą w myśl art. 28m ustawy o CIT, nie podlegając opodatkowaniu ryczałtem.

Uchwała o podziale zysku netto wypracowanego w okresie opodatkowania ryczałtem determinuje zastosowanie stawki zgodnej z rokiem ogłoszenia uchwały, a nie z rokiem zysku. Stawka jest określana według statusu małego/dobrego podatnika w poprzednim roku kalendarzowym.

Jeśli spółka spełnia wszystkie warunki określone w art. 28j ustawy o CIT oraz nie podlega wyłączeniom z art. 28k tejże ustawy, przysługuje jej prawo do wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek kapitałowych od wskazanej daty.

Przychody uzyskiwane przez podatnika z tytułu dochodzenia i egzekwowania wierzytelności, obejmujące wynagrodzenia i zasądzone odsetki, są kwalifikowane jako przychody z wierzytelności w świetle art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. a) ustawy o CIT, co wpływa na możliwość wyboru ryczałtu od dochodów spółek.

Dla ustalenia stawki podatku ryczałtowego nie jest decydujący rok wypracowania zysku przez spółkę, lecz rok podatkowy, w którym podjęto uchwałę o podziale zysku; stawka zależy od statusu podatnika w tym czasie.

Przypadek przebywania pracownika na urlopie bezpłatnym nie stanowi naruszenia warunku zatrudnienia zgodnie z art. 28j ust. 1 pkt 3 lit. a ustawy o CIT, co nie wyklucza możliwości korzystania przez podatnika z ryczałtowego opodatkowania dochodów spółek.

Wypłata przez spółkę z o.o. podzielonego zysku powstałego przed opodatkowaniem ryczałtem nie podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek, w świetle art. 28m ust. 1 ustawy o CIT, niemając związku z zyskiem netto wypracowanym w okresie tego opodatkowania.

Umowa najmu lokali mieszkalnych zawarta między spółką a jej wspólnikiem, realizowana na warunkach rynkowych w ramach podstawowej działalności spółki, nie prowadzi do powstania ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT i nie podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek.

W przypadku przekształcenia spółki z wyborem ryczałtu od dochodów spółek jako formy opodatkowania, dochód z przekształcenia nie powstaje, jeśli pierwszy rok podatkowy po przekształceniu nie zbiega się z pierwszym rokiem opodatkowania ryczałtem.

Wypłaty zysków przez spółkę z o.o. powstałą z przekształcenia spółki cywilnej nie podlegają opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek, jeśli zyski te były uprzednio opodatkowane i wypracowane przez spółkę cywilną przed opodatkowaniem ryczałtem. Przekształcenie spółki cywilnej w spółkę z o.o. jest z kolei zdarzeniem neutralnym podatkowo w zakresie ryczałtu, o ile nie dochodzi do przeszacowania majątku

Brak aktualizacji danych w Krajowym Rejestrze Sądowym nie stanowi formalnej przeszkody do stosowania ryczałtu od dochodu spółek na podstawie art. 28j ust. 1 pkt 5 ustawy o CIT, jeżeli faktyczne posiadanie udziałów w spółce komandytowej występuje na dzień wyboru opodatkowania ryczałtem.