Sprzedaż nieruchomości nie stanowi zbycia przedsiębiorstwa ani jego zorganizowanej części, zatem podlega opodatkowaniu VAT. Możliwa jest rezygnacja ze zwolnienia z VAT przy spełnieniu wymogów formalnych, co czyni transakcję opodatkowaną VAT.
Gmina nie jest uprawniona do zastosowania prewspółczynnika ilościowego przy odliczaniu podatku naliczonego w związku z zadaniami inwestycyjnymi o mieszanym charakterze (gospodarczym i niegospodarczym), gdyż nie zapewnia on rzetelnego odzwierciedlenia rzeczywistego wykorzystania inwestycji, w szczególności nie uwzględnia wydatków na cele przeciwpożarowe.
Wpłaty od rodziców oraz dofinansowanie ze środków Województwa na plan nauki pływania są opodatkowane VAT, gdyż stanowią wynagrodzenie za odpłatne świadczenie usług, a Gmina działa jako podatnik VAT wykonujący działalność gospodarczą. Gmina ma prawo do odliczenia podatku naliczonego związanego z realizacją programu.
Zwolnieniu od podatku VAT podlegają dostawy nieruchomości gruntowych niezabudowanych innych niż budowlane, co wyklucza prawo do odliczenia podatku naliczonego. W przypadku powiązania nabycia z działalnością mieszaną, nie należy stosować prewspółczynnika, jeśli dostawa jest zwolniona z VAT.
Gmina, realizując inwestycję służącą wyłącznie czynnościom opodatkowanym, ma prawo do odliczenia całkowitego podatku naliczonego od poniesionych wydatków, pod warunkiem spełnienia wymogów z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.
Jednostka samorządu terytorialnego nie ma prawa do pełnego odliczenia VAT naliczonego od wydatków na projekty niepowiązane z działalnością opodatkowaną, realizowane w reżimie publicznoprawnym, lecz może odliczyć VAT częściowo od wydatków używanych do działalności opodatkowanej, stosując współczynnik proporcji.
Podatnik może zastosować inną metodę określenia prewspółczynnika, bardziej odpowiadającą specyfice prowadzonej działalności, niż metoda wskazana w rozporządzeniu, pod warunkiem, że zapewnia ona precyzyjniejsze przyporządkowanie podatku naliczonego do czynności dających prawo do odliczenia.
Podatnikowi A. Sp. z o.o. przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego na mocy art. 86 ust. 1 ustawy o VAT za usługi doradcze w zakresie pozyskania inwestora strategicznego, gdy usługi te, ocenione jako koszty ogólne, związane są z działalnością opodatkowaną, nawet w przypadku ich pośredniego wpływu.
Gmina nie ma prawa do obniżenia podatku należnego o VAT naliczony od Wydatku A związanego z działalnością nieopodatkowaną. Natomiast przysługuje jej prawo do częściowego odliczenia VAT od Wydatków B poprzez stosowanie pre-współczynnika oraz proporcji VAT, zgodnie z art. 86 oraz art. 90 ustawy o VAT, odpowiadających specyfice działalności gospodarczej Gminy.
Rozliczenie przez inwestora kosztów powierzenia robót wykonawcom zastępczym ma charakter odszkodowawczy i nie podlega opodatkowaniu VAT. Inwestor nie ma prawa do potrącenia podatku naliczonego z faktur wykonawców zastępczych, a rozliczenia winny być dokonywane poza fakturami VAT.
Dopuszczalne jest przechowywanie Dokumentów księgowych wyłącznie w zdigitalizowanej formie na Elektronicznej Platformie zgodnie z ustalonymi procedurami, pod warunkiem spełnienia wymogów autentyczności, integralności oraz szybkiego dostępu zdefiniowanych w ustawie o VAT. Takie przechowywanie nie pozbawia prawa do odliczenia podatku naliczonego.
Archiwizowanie dokumentów sprzedażowych i zakupowych wyłącznie w formie elektronicznej jest dopuszczalne na gruncie ustawy o VAT, o ile zostaną spełnione warunki zapewniane przez kontrole biznesowe dotyczące autentyczności, integralności i czytelności dokumentów, oraz przy zachowaniu prawa do odliczenia podatku vat naliczonego na podstawie tych dokumentów.
Podatnikowi przysługuje ograniczone prawo do odliczenia podatku naliczonego wynikającego z faktur związanych z projektem współfinansowanym ze środków UE jedynie w proporcji odpowiadającej wykorzystaniu zakupionych towarów i usług do działalności gospodarczej, zgodnie z art. 86 ust. 2a-2h ustawy o VAT.
Świadczenie przez Gminę odpłatnych usług odbioru ścieków na rzecz odbiorców zewnętrznych stanowi działalność gospodarczą opodatkowaną VAT, niekorzystającą ze zwolnienia z tego podatku. Gmina ma prawo do odliczenia części podatku naliczonego na podstawie prewspółczynnika metrażowego, jako bardziej reprezentatywnego dla specyfiki jej działalności niż metoda ustawowa.
Przechowywanie dokumentów sprzedażowych i zakupowych wyłącznie w formie elektronicznej, przy spełnieniu warunków wynikających z art. 106m, 112 i 112a ustawy o VAT, jest dopuszczalne i nie wpływa negatywnie na prawo do odliczenia podatku naliczonego. Procedura elektronicznego przechowywania musi zapewniać autentyczność pochodzenia, integralność treści i ich czytelność.
Podatnik, jako szpital prowadzący badania kliniczne stanowiące działalność opodatkowaną VAT, ma prawo na podstawie art. 86 ust. 1 ustawy o VAT do odliczenia podatku naliczonego od wydatków inwestycyjnych związanych z tą działalnością, pod warunkiem, że wydatki te są niezbędne do wykonania czynności opodatkowanych i nie zachodzą przesłanki wykluczające odliczenie.
W myśl art. 90 ustawy o VAT proporcja do odliczenia podatku musi opierać się na kalkulacji obrotu wynikającego z transakcji opodatkowanych i zwolnionych, nie zaś na metodzie udziału powierzchniowego gruntów, jako że nie stanowi to bezpośredniej alokacji podatku.
Jednostki samorządu terytorialnego mają prawo do pełnego odliczenia podatku VAT naliczonego od wydatków związanych z nabyciem dóbr wykorzystywanych do działalności opodatkowanej na podstawie umów cywilnoprawnych, takich jak dzierżawa, spełniających warunki czynności opodatkowanej.
Odpłatne udostępnianie basenu przez Gminę stanowi działalność gospodarczą podlegającą opodatkowaniu VAT, co uzasadnia prawo do pełnego odliczenia VAT od związanych z tym wydatków, mimo zwolnień do lat 3 obejmujących opiekunów jako odpłatnych uczestników.
Wydatki związane z inwestycją publiczną, niewykorzystywaną do czynności opodatkowanych, nie dają prawa do odliczenia podatku naliczonego VAT, ani prawa do jego zwrotu.
Przechowywanie faktur wyłącznie w formie elektronicznej, po digitalizacji oryginałów papierowych, jest zgodne z przepisami prawa podatkowego, o ile wdrożone zostaną systemy kontroli biznesowych, zapewniające autentyczność pochodzenia, integralność oraz czytelność dokumentów od chwili ich wystawienia do czasu upływu terminu przedawnienia zobowiązania podatkowego.
Podatnik realizujący projekt związany z działalnością mieszaną, w sytuacji gdy proporcja odliczenia podatku naliczonego nie przekracza 2%, ma prawo uznać, że proporcja wynosi 0% i nie odliczać podatku naliczonego, ale prawo wyboru pozwala również na częściowe odliczenie zgodnie z wyliczoną proporcją, co nie czyni stanowiska o braku możliwości odliczenia całkowicie słusznym.
Jednostka samorządu terytorialnego nie ma prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego od wydatków inwestycyjnych, które są realizowane w ramach zadań własnych gminy, nie generując przy tym czynności opodatkowanych VAT.
W przypadku przyznania upustu za ograniczenie zużycia energii elektrycznej oraz otrzymania za ten upust rekompensaty, nie zachodzi obniżenie podstawy opodatkowania i kwoty podatku należnego, co uprawnia nabywcę energii do pełnego odliczenia podatku VAT wykazanego na fakturach.