W przypadku podziału spółki przez wydzielenie, jeżeli zarówno spółka dzielona, jak i przejmująca są opodatkowane ryczałtem od dochodów spółek, to spółka przejmująca zachowuje prawo do estońskiego CIT, zgodnie z art. 28I ust. 1 pkt 4 lit. c ustawy o CIT.

Wynagrodzenie za umorzenie udziałów, finansowane zarówno z zysku ryczałtowego, jak i z kapitału zapasowego pochodzącego z agio, stanowi dochód z tytułu ukrytych zysków i podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek na podstawie art. 28m ust. 3 pkt 5 ustawy o CIT.

Wynagrodzenie wypłacane za nabywane towary od podmiotu powiązanego przez spółkę korzystającą z estońskiego CIT, o ile ustalone na warunkach rynkowych i niezwiązane z prawem do udziału w zysku, nie jest kwalifikowane jako dochód z ukrytych zysków na podstawie art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT, wobec braku przesłanek do jego opodatkowania ryczałtem.

Wydatki na zakup palet drewnianych od osób fizycznych, przeznaczonych do dalszej odsprzedaży, udokumentowane zgodnie z wymogami ustawy o rachunkowości, są związane z działalnością gospodarczą spółki opodatkowanej ryczałtem i nie stanowią dochodu z tytułu wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą.

Zaległe składki ZUS opłacone przez podatnika są wydatkami związanymi z działalnością gospodarczą i mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów, a nie uznane za wydatki niezwiązane z działalnością opodatkowujące ryczałtem, co potwierdza brak związku z art. 28m ust. 1 pkt 3 ustawy o CIT.

Przychody z wynajmu boksów dla koni, obejmujące świadczenia dodatkowe (karmienie, pojenie, wyprowadzanie na padok) nie stanowią przychodów z tytułu najmu prywatnego, lecz kwalifikują się do pozarolniczej działalności gospodarczej z uwagi na ich zorganizowany, ciągły oraz zarobkowy charakter.

Usługi zarządzania projektami związane z inżynierią, nieobejmujące działalności budowlanych, mogą podlegać zryczałtowanemu podatkowi od przychodów ewidencjonowanych w stawce 8,5%, jeżeli z zakresu świadczonych usług wynika, iż mają one charakter organizacyjny i koordynacyjny, zgodnie z PKWiU 70.22.20.0.

Wynagrodzenie wypłacane przez A na rzecz B z tytułu usług i transakcji nie stanowi ukrytych zysków ani wydatków niezwiązanych z działalnością gospodarczą na podstawie art. 28m ust. 1 pkt 2 i 3 ustawy o CIT, co oznacza brak opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek po stronie A.

Usługi koordynacji prac rozruchowych, jako pozostałe usługi zarządzania projektami (PKWiU 70.22.20.0), nieobjęte projektami budowlanymi, mogą być opodatkowane ryczałtem w wysokości 8,5% zgodnie z art. 12 ust. 1 pkt 5 lit. a) ustawy o zryczałtowanym podatku dochodowym.

Środki otrzymywane z tytułu zaliczki i funduszu gwarancyjnego w ramach umowy faktoringu stanowią "przychód z wierzytelności" w rozumieniu art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. a ustawy o CIT, co wpływa na możliwość korzystania z CIT Estońskiego.

Wypłata przez spółkę z o.o. zysków z lat ubiegłych wypracowanych w ramach jednoosobowej działalności gospodarczej, które zostały wcześniej opodatkowane podatkiem PIT, nie skutkuje powstaniem dochodu podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek na podstawie art. 28m Ustawy o CIT.

Posiadanie przez wspólnika spółki statusu fundatora fundacji i członka jej zarządu, bez prawa do świadczeń majątkowych, nie wyklucza opodatkowania spółki ryczałtem od dochodów spółek.

W przypadku inwestowania w obligacje zerokuponowe przez spółkę, przychód uwzględniany przy ocenie warunków art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. f ustawy o CIT obejmuje zarówno dyskonto, jak i zwrot kapitału, stanowiąc całość realizacji praw z instrumentów finansowych.

W kontekście art. 30a ust. 19 ustawy o PIT, wspólnik spółki opodatkowanej ryczałtem od dochodów ma prawo do pomniejszenia zryczałtowanego podatku dochodowego od dywidend niemających statusu ostatecznego przysporzenia o określony procent należnego ryczałtu, mimo jego niezapłacenia.

Przy opodatkowaniu w formie ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych podstawę opodatkowania stanowi całość przychodu uzyskanego z działalności edukacyjnej prowadzonej poprzez platformę internetową, bez uwzględnienia prowizji platformy.

Dofinansowanie składek na ubezpieczenie na życie dla członków zarządu oraz powiązanych pracowników, przyznawane na zasadach wewnętrznego regulaminu spółki, nie stanowi ukrytych zysków podlegających opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek, zgodnie z art. 28m ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT. Świadczenia te są przyznawane w oparciu o obiektywne kryteria oraz funkcję pełnioną w spółce.

Przychody z usług zarządzania projektami IT, sklasyfikowane jako PKWiU 70.22.20.0 Pozostałe usługi zarządzania projektami, podlegają opodatkowaniu ryczałtem ewidencjonowanym stawką 8,5%, o ile nie stanowią usług doradztwa związanych z zarządzaniem, dla których właściwa byłaby stawka 15%.

Podatnik estońskiego CIT musi spełniać warunek zatrudniania co najmniej trzech osób na pełnych etatach przez 300 dni roku podatkowego, co oznacza, że sumaryczne łączenie etatodni nie jest dopuszczalne.

Do skutecznego wyboru opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek (estoński CIT) konieczne jest sporządzenie oraz prawidłowe podpisanie sprawozdania finansowego w ustawowym terminie. Późniejsze podpisanie sprawozdania uznawane jest za jego niesporządzenie zgodnie z wymogami ustawy o rachunkowości, co uniemożliwia wybór tej formy opodatkowania.

Przejęcie przez spółkę opodatkowaną Estońskim CIT innego podmiotu nie powoduje utraty prawa do opodatkowania ryczałtem, jeśli przejęta spółka spełni wymogi zamknięcia ksiąg oraz sporządzenia sprawozdania finansowego, a rozliczenie dokonane zostanie metodą łączenia udziałów bez przeszacowania wartości składników majątku.

Wynagrodzenie otrzymane przez jednoosobową działalność gospodarczą wspólnika za usługi świadczone dla spółki nie stanowi ukrytego zysku i nie podlega opodatkowaniu estońskim CIT, gdyż transakcje mają uzasadnienie biznesowe i zostały zrealizowane na warunkach rynkowych.

Wypłata zysków wypracowanych przed przekształceniem jednoosobowej działalności gospodarczej w spółkę z o.o. nie podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób prawnych po zadeklarowaniu przez spółkę opodatkowania ryczałtem, albowiem nie spełnia przesłanek uznania za dochód z tytułu podzielonego zysku lub ukrytych zysków. Zyski te nie były bowiem wypracowane w czasie opodatkowania ryczałtem.

Czynsz najmu nieruchomości płacony przez spółkę z o.o. od wspólników i ich teściów w warunkach rynkowych, potrzebny do prowadzenia działalności gospodarczej, nie jest ukrytym zyskiem w świetle art. 28m ust. 3 w zw. z ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT.

Przychody uzyskane z faktoringu własnych wierzytelności stanowią przychody z wierzytelności w rozumieniu art. 28j ust. 1 pkt 2 ustawy o CIT. Przekroczenie progu 50% przychodów z takich źródeł wyklucza możliwość opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek.