Spółka, jako mała instytucja płatnicza, może korzystać z opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, gdy nie jest przedsiębiorstwem finansowym ani instytucją pożyczkową, co wyklucza zastosowanie art. 28k ust. 1 ustawy o CIT.

Wypłata wynagrodzenia z tytułu najmu nieruchomości przez Spółkę na rzecz wspólnika, dokonywana na warunkach rynkowych i wynikająca z faktycznych potrzeb biznesowych, nie stanowi ukrytego zysku w rozumieniu art. 28m ustawy o CIT i nie podlega estońskiemu CIT.

Wypłata zysków wypracowanych przed okresem opodatkowania estońskim CIT, nawet jeśli następuje w trakcie stosowania tego reżimu, nie podlega opodatkowaniu ryczałtem. Zyski wypracowane w okresie estońskiego CIT, ale przeznaczone do wypłaty po jego zakończeniu, podlegają opodatkowaniu ryczałtem.

Przychody z działalności gospodarczej sklasyfikowanej jako usługi związane ze zwalczaniem pożarów, ochroną przeciwpożarową oraz edukacją są opodatkowane 8,5% stawką ryczałtu ewidencjonowanego, przy spełnieniu odpowiednich wymogów formalnych i prowadzeniu stosownej ewidencji przychodów.

Przychody uzyskiwane przez Spółkę od podmiotu powiązanego, przekraczające 50% przychodów, stanowią przychody z transakcji wytwarzających wartość dodaną, co uprawnia do opodatkowania dochodów ryczałtem od dochodów spółek, spełniając warunki art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. g ustawy o CIT.

Wynagrodzenie wypłacane przez spółkę A spółce B za usługi podwykonawstwa, ustalone na warunkach rynkowych, nie stanowi ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy o CIT, a zatem nie podlega opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek.

Używanie przez wspólników pojazdów spółki do celów prywatnych skutkuje powstaniem ukrytych zysków, a podstawę opodatkowania ryczałtem stanowią 50% wydatków eksploatacyjnych w danym okresie rozliczeniowym. Opodatkowanie ma miejsce za cały miesiąc użytkowania prywatnego.

Spółka podlegająca opodatkowaniu ryczałtem traci prawo do tego opodatkowania, jeżeli w wyniku łączenia bądź podziału przejmuje przedsiębiorstwo, chyba że podmiot przejmowany zamknie księgi rachunkowe, sporządzi sprawozdanie finansowe i dokona rozliczeń zgodnie z art. 7aa ustawy CIT. Brak spełnienia tych warunków skutkuje utratą prawa do ryczałtu z końcem roku poprzedzającego połączenie.

Podatnik, u którego powyżej 50% przychodów pochodzi z transakcji z podmiotem powiązanym, spełnia warunek opodatkowania ryczałtem, gdy w ramach tych transakcji powstaje znacząca nie-znikoma wartość dodana.

Zobowiązanie podatkowe wynikające z korekty wstępnej dokonanej w związku z połączeniem spółek wygasa, jeśli spółka, jako podatnik, zachowuje opodatkowanie ryczałtem od dochodów spółek przez cztery lata od daty złożenia zawiadomienia ZAW-RD, nieprzerwanie kontynuując te zasady podatkowe.

Transakcje X Sp. z o.o. z podmiotem powiązanym, dotyczące zarządzania magazynem i kompletacji zamówień, nie kwalifikują się jako operacje bez wytworzenia wartości dodanej, co pozwala na stosowanie ryczałtu CIT Estońskiego. Ponadto wynagrodzenia wypłacane za towary od Podmiotu powiązanego nr 1 nie generują ukrytych zysków.

Wybór formy opodatkowania przez oznaczenie w tytule przelewu zaliczki podatku jako PPE, dokonany w ustawowym terminie, spełnia wymogi oświadczenia o wyborze ryczałtu od przychodów ewidencjonowanych i uznaje się za skuteczny wybór formy opodatkowania.

Transakcje między spółkami powiązanymi, przeprowadzane na warunkach rynkowych, nie są uznawane za ukryte zyski lub wydatki niezwiązane z działalnością gospodarczą na gruncie Estońskiego CIT. Ponadto, spółki nie mają obowiązku sporządzania lokalnej dokumentacji cen transferowych, jeżeli nie wykazują straty netto.

Zastosowanie pomniejszenia podatku dochodowego od zaliczek na poczet dywidendy uzyskanych z zysków podzielonych w okresie estońskiego CIT wymaga formalnego wyodrębnienia tych zysków w kapitale spółki przed ich wypłatą, zgodnie z art. 30a ust. 19 PIT.

Zatrudnienie co najmniej trzech lekarzy na pełne etaty, pracujących wyłącznie w ramach zdalnych teleporad, spełnia wymóg objęcia ryczałtem od dochodów, o ile lekarze nie są udziałowcami lub wspólnikami podatnika. Forma umowy o pracę i praca zdalna są dopuszczalne dla odliczenia w warunkach ustawy CIT.

Utworzenie zagranicznego oddziału przez spółkę opodatkowaną estońskim CIT nie skutkuje utratą prawa do tego opodatkowania, o ile warunki z art. 28j ust. 1 pkt 5 ustawy o CIT pozostają spełnione.

Transakcje związane z dzierżawą gruntu oraz zwrotem nakładów inwestycyjnych na ten grunt, ustalone na warunkach rynkowych, nie stanowią ukrytych zysków w rozumieniu art. 28m ust. 3 ustawy CIT, a tym samym nie podlegają opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek (estoński CIT).

Dochody z rozliczenia instrumentów pochodnych, nawet jeśli są bezpośrednio powiązane z podstawową działalnością gospodarczą podatnika i nie mają charakteru spekulacyjnego, stanowią przychody pasywne ze zbycia i realizacji praw z instrumentów finansowych art. 28j ust. 1 pkt 2 lit. f ustawy o CIT, które muszą być uwzględniane przy ustaleniu prawa do opodatkowania ryczałtem od dochodu spółek.

Wykonanie opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek wymaga spełnienia wymogu zamknięcia ksiąg i sporządzenia sprawozdania finansowego zgodnie z przepisami, w tym w formie elektronicznej z kwalifikowanym podpisem. Niespełnienie tych wymogów skutkuje koniecznością rozliczenia na zasadach ogólnych.

Stawkę podatku CIT w przypadku podziału zysku wypracowanego przez spółkę opodatkowaną ryczałtem określa się według statusu podatnika (mały lub duży), ustalonego w roku, w którym podjęto uchwałę o podziale zysku.

Podatnik, który zmienia formę opodatkowania na ryczałt od dochodów spółek od drugiego roku działalności, nie może korzystać z preferencyjnych warunków zatrudnienia przewidzianych w art. 28j ust. 2 pkt 2 ustawy o CIT, zarezerwowanych dla podatników rozpoczynających działalność gospodarczej i wybierających ryczałt od samego początku działalności.

W przypadku wypłaty zysków skumulowanych w okresie opodatkowania ryczałtem od dochodów spółek, stosuje się stawkę podatkową obowiązującą w ostatnim roku opodatkowania ryczałtem, niezależnie od momentu podjęcia uchwały o wypłacie tych zysków.

Fundatorzy lub członkowie zarządu fundacji, będący wspólnikami spółki, nie są wyłączeni z opodatkowania Estońskim CIT, o ile nie posiadają praw majątkowych do świadczeń fundacji, zgodnie z art. 28j ust. 1 pkt 4 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.

Opodatkowaniu ryczałtem podlega dochód z tytułu nieujawnionych operacji gospodarczych, powstający z pominięcia ujawnienia zdarzenia gospodarczego w odpowiednim okresie rachunkowym, bez względu na przyczyny nieterminowego rozliczenia faktury kosztowej.