W przypadku niekomercyjnego wykorzystania inwestycji przez jednostkę samorządu terytorialnego do realizacji zadań własnych, czynności te nie są opodatkowane VAT, a tym samym, brak prawa do odliczenia podatku naliczonego od związanych z nimi wydatków.
Sprzedaż praw majątkowych oraz odpłatne udzielanie licencji przez Instytut z tytułu rezultatów działań projektowych podlega opodatkowaniu VAT, co wiąże się z prawem do pełnego odliczenia VAT naliczonego na dokonywane zakupy, gdyż czynności te są podejmowane w ramach działalności opodatkowanej Instytutu.
Podatnik ma prawo do odliczenia 100% VAT od wydatków na pojazd użytkowany wyłącznie do działalności, przy spełnieniu wymagań art. 86a ustawy o VAT. Incydentalne wykorzystanie do celów prywatnych, zgłoszone poprzez VAT-26 i skutkujące 50% odliczeniem, nie wpływa negatywnie na prawo do pełnego odliczenia w innych miesiącach.
Czynny podatnik VAT może odliczyć podatek naliczony z faktur, które nie zawierają NIP, jeśli faktury dokumentują rzeczywiste transakcje związane z działalnością opodatkowaną, jak najem lokali usługowych.
Wpłaty mieszkańców i dotacje w ramach budowy przydomowych oczyszczalni ścieków są nieopodatkowane VAT. Gmina nie wykonuje działalności gospodarczej, a wydatki nie związane z czynnościami opodatkowanymi uniemożliwiają odliczenie VAT.
Gmina, wykonując mieszane czynności opodatkowane i nieopodatkowane w zmodernizowanym obiekcie, uprawniona jest do częściowego odliczenia podatku VAT naliczonego z tytułu dokonanych zakupów, stosując prewspółczynnik odliczeniowy jednostki organizacyjnej OSiR zgodnie z art. 86 ustawy o VAT.
Gmina nie posiada prawa do odliczenia podatku VAT naliczonego z tytułu zakupu samochodu ratowniczo-gaśniczego, ponieważ pojazd ten służy wykonywaniu zadań publicznoprawnych niepodlegających opodatkowaniu VAT, zgodnie z art. 86 ust. 1 oraz art. 15 ust. 6 ustawy o podatku od towarów i usług.
Gmina ma prawo do częściowego odliczenia VAT od inwestycji kanalizacyjnych według prewspółczynnika metrażowego, ale nie od inwestycji drogowych, gdyż te pozostają w zakresie zadań własnych gminy niepodlegających VAT.
Przy realizacji inwestycji polegającej na budowie kotłowni i sieci ciepłowniczej, Gmina jako czynny podatnik VAT, ma prawo do odliczenia 100% podatku naliczonego, jeżeli inwestycja służy wyłącznie czynnościom opodatkowanym, a jednostka organizacyjna korzystająca z inwestycji działa w jej imieniu.
Instalacja fotowoltaiczna dla budynku użyteczności publicznej, umożliwiająca Gminie dostawę energii do sieci, stanowi działalność gospodarczą. Wydatki na jej zakup mogą być przedmiotem częściowego odliczenia VAT, gdyż związane są z czynnościami opodatkowanymi. Pozostałe wydatki dotyczące termomodernizacji budynku, nie służące czynnościom opodatkowanym, nie dają prawa do odliczenia podatku VAT.
Wniesienie aportem Inwestycji do Spółki nie stanowi zbycia przedsiębiorstwa ani zorganizowanej jego części, co wyklucza wyłączenie z opodatkowania VAT zgodnie z art. 6 pkt 1 ustawy o VAT; stanowi jednakże opodatkowaną dostawę towarów, uprawniającą do odliczenia VAT naliczonego.
Zarejestrowanemu czynnym podatnikowi VAT, który zrealizował inwestycję służącą wyłącznie czynnościom opodatkowanym (dostawa wody), przysługuje pełne prawo do odliczenia podatku naliczonego od wydatków związanych z tą inwestycją, pod warunkiem braku przesłanek negatywnych opisanych w art. 88 ustawy o VAT.
Wniesienie infrastruktury wodno-kanalizacyjnej aportem do Spółki podatkowo-cywilnoprawnej przez Gminę, jako towaru w rozumieniu ustawy o VAT, podlega opodatkowaniu podatkiem VAT i nie korzysta z wyłączenia na podstawie art. 6 pkt 1 ustawy, gdyż nie stanowi zbycia przedsiębiorstwa ani jego zorganizowanej części.
Miasto nie może odliczyć podatku VAT naliczonego od wydatków związanych z realizacją Programu Rozwoju Miast, gdyż działania te są nieopodatkowane i mieszczą się w ramach zadań publicznoprawnych, wyłączających Miasto z kategorii podatnika VAT.
W przypadku podatnika ponoszącego wydatki na projekty związane zarówno z działalnością opodatkowaną jak i nieopodatkowaną, odliczenie VAT jest dozwolone tylko proporcjonalnie w zakresie przypisania do działalności opodatkowanej, a przy prewspółczynniku
Odpłatne udostępnianie pomieszczeń i wprowadzanie energii do sieci przez Gminę podlegają opodatkowaniu VAT, co stanowi działalność gospodarczą. Natomiast nieodpłatne udostępnianie przestrzeni dla zadań statutowych Sołectwa nie podlega opodatkowaniu VAT jako realizacja zadań publicznych. Gmina ma prawo do odliczenia VAT naliczonego z zastosowaniem prewspółczynnika, gdy wydatki są wykorzystywane do działalności
Podatnik samodzielnie występujący jako wynajmujący może opodatkować podatkiem VAT najem nieruchomości objętej wspólnością małżeńską, a także odliczać pełny VAT naliczony z związanych z tym wydatków, o ile służą one działalności opodatkowanej.
Koszty sporządzenia planu ogólnego, realizujące zadania własne gminy, nie uprawniają do odliczenia podatku VAT. Związane są głównie z działalnością niepodlegającą opodatkowaniu, co wyklucza uznanie ich za wydatki związane z działalnością opodatkowaną i uzasadnia odmowę prawa do odliczenia.
Odpłatna dostawa nieruchomości obejmującej prawo użytkowania wieczystego działki oraz budynki i budowle na niej posadowione jest zwolniona z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT, lecz strony mogą zrezygnować ze zwolnienia i opodatkować transakcję na zasadach ogólnych, jeśli obie są czynnymi podatnikami VAT.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT od wydatków na badania geologiczne i uzyskanie koncesji, gdy wydatki te są związane z przyszłą działalnością podlegającą opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług, mimo że działalność ta jeszcze nie została rozpoczęta.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia części podatku VAT od kombajnu zbożowego zakupionego przed rejestracją jako czynny podatnik, w formie korekty na podstawie art. 91 ust. 1 i ust. 7 ustawy o VAT, pod warunkiem spełnienia wymogów rejestracyjnych i prowadzenia działalności opodatkowanej tym kombajnem.
Podatnikowi nie przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego w związku z realizacją projektu, którego efekty będą wykorzystywane wyłącznie do czynności zwolnionych z podatku VAT.
Gminie przysługuje prawo do zastosowania alternatywnego pre-współczynnika dla odliczenia VAT od wydatków cmentarnych, gdy przewidziana w rozporządzeniu metoda nie uwzględnia specyfiki działalności gospodarczej, a zaproponowany przez Gminę pre-współczynnik bardziej odzwierciedla rzeczywisty zakres tej działalności.
Spadkobiercy przedsiębiorstwa w spadku przysługuje prawo do odliczenia podatku VAT z faktur wystawionych na przedsiębiorstwo, o ile spadkobierca kontynuuje działalność i towary są wykorzystywane do czynności opodatkowanych.