Rok podatkowy fundacji rodzinnej może być zmieniony zgodnie z nowym statutem przed jego rejestracją przez sąd, jeśli zmiana zostanie zgłoszona w zeznaniu podatkowym, a statut przewiduje taką możliwość.

Świadczenia pieniężne otrzymane od fundacji, prowadzącej statutową działalność w sferze pomocy społecznej, są zwolnione z opodatkowania podatkiem dochodowym od osób fizycznych na podstawie art. 21 ust. 1 pkt 79 ustawy o PIT, niezależnie od braku formalnych kryteriów przyznawania świadczeń przez tę organizację.

Zmiana roku podatkowego fundacji rodzinnej skuteczna jest od momentu jej dokonania i nie zależy od daty rejestracji zmiany statutu przez sąd, pod warunkiem iż zostanie zgłoszona w wymaganym terminie w zeznaniu CIT.

Fundacja, jako płatnik podatku dochodowego od stypendiów, ma obowiązek wystawiania PIT-11, natomiast nie musi pobierać zaliczek, jeśli student złoży odpowiedni wniosek. W kontekście rezydencji podatkowej cudzoziemców pozwala się na stosowanie oświadczeń, przy założeniu ich zgodności z przepisami Ustawy o PIT, bez wymogu certyfikatów rezydencji, chyba że stosuje się umowy o unikaniu podwójnego opodatkowania

Wydatki ponoszone przez spółkę na rzecz uchodźców z Ukrainy, w części związanej z otrzymywanym świadczeniem pieniężnym od fundacji, nie stanowią kosztów uzyskania przychodów bezpośrednio związanych z przychodami, gdyż brak jest związku z prowadzoną działalnością gospodarczą oraz celem uzyskania, zabezpieczenia lub zachowania przychodów.

Udzielenie przez Fundację Rodzinną pożyczek pieniężnych Beneficjentowi, które podlegają opodatkowaniu podatkiem od towarów i usług oraz korzystają ze zwolnienia z podatku VAT, nie podlega opodatkowaniu podatkiem od czynności cywilnoprawnych zgodnie z art. 2 pkt 4 lit. b) ustawy o PCC.

Usługi treningów personalnych świadczone przez fundację korzystają ze zwolnienia od VAT jako ściśle związane ze sportem. Zwolnienie nie obejmuje usług rehabilitacyjnych i podobnych, które nie spełniają warunków ustawowych, nie stanowiąc usług ściśle związanych ze sportem w rozumieniu art. 43 ust. 1 pkt 32 ustawy o VAT.

Działalność fundacji rodzinnej polegająca na nabywaniu i zbywaniu papierów wartościowych, w tym certyfikatów CC ETF, mieści się w dopuszczalnym zakresie działalności gospodarczej, zgodnie z art. 5 ustawy o fundacji rodzinnej, i nie podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym według art. 24r ustawy o CIT.

Dochody z użytkowania akcji przez fundację rodzinną nie są zwolnione z opodatkowania na podstawie art. 6 ust. 1 pkt 25 UPDOP, gdyż użytkowanie nie stanowi dozwolonej działalności zgodnie z art. 5 ust. 1 pkt 3 UFR. Wypłata dywidend na rzecz fundacji nakłada obowiązek podatkowy na spółkę jako płatnika.

Usługi organizacji obozów artystycznych dla dzieci, choć obejmujące opiekę, są klasyfikowane jako usługi turystyki podlegające opodatkowaniu marżą. Zwolnienie z VAT według art. 43 ust. 1 pkt 24 lit. a nie obejmuje całości kompleksowej usługi organizacji obozu, a jedynie elementy opiekuńcze świadczone zgodnie z przepisami o systemie oświaty.

Nieodpłatne udostępnienie przez Fundację rodzinną Nieruchomości nr 1 na rzecz beneficjentów stanowi świadczenie opodatkowane stawką 15% CIT, jako opisane w art. 24q ust. 1 pkt 1 ustawy o CIT, pomimo ogólnego zwolnienia fundacji rodzinnych z podatku dochodowego od osób prawnych.

Wniesienie nieruchomości nr 1 do Fundacji przez osobę fizyczną nieprowadzącą działalności gospodarczej, jako czynność mająca charakter zarządu majątkiem prywatnym, nie stanowi działalności gospodarczej w rozumieniu ustawy o VAT i pozostaje poza zakresem opodatkowania podatkiem od towarów i usług.

Przeniesienie nieruchomości przez osobę fizyczną do fundacji rodzinnej, na zasadzie nieodpłatnego wniesienia, nie skutkuje powstaniem przychodu podatkowego dla osoby fizycznej, jeśli nie otrzymuje ona ekwiwalentu. Osoby będące beneficjentami fundacji, które należą do tzw. "zerowej grupy podatkowej", korzystają ze zwolnienia z podatku dochodowego od osób fizycznych w odniesieniu do świadczeń nieodpłatnego

Świadczenia przekazywane przez fundację rodzinną na rzecz jej fundatorów, będących jednocześnie beneficjentami, są w całości zwolnione z podatku dochodowego od osób fizycznych, pod warunkiem, że wartość mienia wniesionego przez fundatora i jego małżonka proporcjonalnie odpowiada 100% wartości sumy mienia wniesionego do fundacji przez wszystkich fundatorów.

Czynność cywilnoprawna dokonana przez organizację pożytku publicznego nie kwalifikuje się do zwolnienia z podatku od czynności cywilnoprawnych, jeśli choć częściowo pozostaje w związku z działalnością odpłatną, mimo jej nieodpłatnego charakteru jako całości.

Wykonanie świadczenia niepieniężnego w celu regulacji zobowiązań z tytułu dywidendy lub likwidacji prowadzi do powstania podatkowego przychodu, odpowiadającego wartości zobowiązania bądź wyższej wartości rynkowej świadczenia, zgodnie z art. 14a ustawy o CIT.

Środki finansowe z grantu przekazane na konto osoby fizycznej, wykorzystywane w całości na cele działania społecznego i zgodne z umową grantową, które nie powodują definitywnego powiększenia majątku tej osoby, nie stanowią przychodu w rozumieniu art. 11 ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Fundacja, organizując odpłatne wyjazdowe rekolekcje, działa jako podatnik VAT w rozumieniu art. 15 ust. 1 ustawy o VAT; działalność ta nie jest zwolniona na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 31 lit. b) ze względu na niespełnienie wszystkich kryteriów zwolnienia.

Wypłata zatrzymanych zysków zysków przez spółkę przekształconą na rzecz wcześniejszych wspólników, a po przekształceniu niewłaścicieli udziałów, nie podlega wyłączeniu z opodatkowania jako przychody z kapitałów pieniężnych, ale stanowi przychód z innych źródeł, obciążając spółkę obowiązkiem informacyjnym.

Udzielanie pożyczek pieniężnych przez Fundację na rzecz Beneficjenta stanowi działalność gospodarczą podlegającą opodatkowaniu VAT, jednakże korzysta ze zwolnienia od podatku na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 38 ustawy o VAT.

Usługi sportowe świadczone przez Fundację w formie klubu sportowego, polegające na organizacji treningów, są zwolnione od podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 32 ustawy o VAT, gdyż są niezbędne do uprawiania sportu i nie są skierowane na osiąganie zysku.

Fundacja, prowadząca działalność kulturalną zwolnioną z podatku VAT i niezarejestrowana jako czynny podatnik VAT, nie ma prawa do odliczenia podatku naliczonego od wydatków związanych z utworzeniem miejsc pracy. Brak czynności opodatkowanych wyklucza możliwość odliczenia zgodnie z art. 86 ust. 1 ustawy o VAT.

Usługi sportowe świadczone przez fundację prowadzącą działalność statutową w zakresie wspierania sportu mogą korzystać ze zwolnienia od VAT, o ile spełnione są warunki art. 43 ust. 1 pkt 32 ustawy o VAT, przy braku działalności marketingowej oraz przeznaczeniu zysków na rozwój działalności.

Darowizna przedsiębiorstwa na rzecz fundacji rodzinnej nie generuje przychodu podatkowego po stronie fundatora, gdyż nie spełnia definicji przychodu jako wartości majątkowych lub świadczeń otrzymanych z ekwiwalentem, zgodnie z art. 11, 14 i 20 ustawy o PDOF.