Podatnik jest uprawniony do korzystania ze zwolnienia z podatku dochodowego, o którym mowa w art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, począwszy od miesiąca, w którym wykazano pierwszy przychód (dochód) z nowej inwestycji realizowanej na podstawie decyzji o wsparciu, niezależnie od daty poniesienia pierwszych kosztów kwalifikowanych.

Korekty cen transferowych dotyczące transakcji wewnątrzgrupowych spełniają warunki art. 11e ustawy o CIT, kiedy po zakończeniu okresu wykryto odchylenia od poziomu rynkowego. Zmiany są rozpoznawane w roku pierwotnego ujęcia transakcji i mogą wpływać na dochody zwolnione z CIT w ramach SSE oraz na podstawie decyzji o wsparciu inwestycji.

Wydatki na nabycie nieruchomości kwalifikują się do zwolnienia podatkowego z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, o ile przyczyniają się do zwiększenia zdolności produkcyjnych; wydatki na części socjalno-biurowe nie spełniają tego warunku i nie mogą być uznane za kwalifikowane.

Do momentu zakończenia inwestycji określonego w decyzji o wsparciu, dochody i koszty działalności inwestycyjnej kwalifikują jako opodatkowane, a spółka może korzystać z ulg o ile koszty nie zmniejszają dochodu zwolnionego. Straty przed zakończeniem inwestycji rozlicza się według generalnych reguł CIT.

Zmiana składu wspólników w spółce jawnej nie wpływa na prawo do stosowania zwolnienia podatkowego z art. 21 ust. 1 pkt 63b ustawy o PIT przez uczestników w proporcji odpowiadającej ich udziałowi w zyskach.

Korekta rentowności dokonana w ramach działalności spółki działającej zarówno w SSE, jak i poza nią, powinna być alokowana proporcjonalnie do udziału przychodów strefowych w całkowitych przychodach spółki, tak, aby uzyskane przychody lub zmniejszone koszty odnosiły się adekwatnie do działalności zwolnionej z podatku dochodowego od osób prawnych, zgodnie z udziałem tej działalności w całkowitych przychodach

Podatnik prowadzący działalność na terenie specjalnej strefy ekonomicznej, objętą zezwoleniem i decyzją o wsparciu, zobowiązany jest do prowadzenia odrębnych ewidencji rachunkowych dla dochodów z każdego z dokumentów, a zwolnienia podatkowe muszą być rozliczane dla każdego źródła oddzielnie.

Dochody z działalności gospodarczej prowadzonej na terenie strefy ekonomicznej mogą korzystać ze zwolnienia podatkowego jedynie w zakresie, w jakim są generowane przez nową inwestycję opisano w decyzji o wsparciu, a nie wyłącznie na podstawie poniesienia kosztów kwalifikowanych.

Przychody i koszty związane z obrotem paletami, jako integralnymi elementami transportu wyrobów gotowych, mogą być kwalifikowane do dochodu objętego zwolnieniem z opodatkowania, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a Ustawy o CIT, jeśli pozostają w ścisłym związku z działalnością objętą wsparciem dla nowej inwestycji.

Zwrotne koszty kwalifikowane na nowe inwestycje, które uzależniają prawo do zwolnienia podatkowego, muszą zostać faktycznie poniesione i ujawnione jako środki trwałe w ewidencji. Zwolnienie może być realizowane od momentu generowania dochodów z działalności powstałej na podstawie tych inwestycji, a nie wyłącznie na etapie ponoszenia kosztów.

Wykorzystanie infrastruktury dofinansowanej z Kredytu Technologicznego nie ogranicza prawa do zwolnienia w ramach PSI, o ile koszty są rozłączne, a maksymalna wielkość pomocy publicznej nie zostaje przekroczona.

Zwolnienie podatkowe na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT przysługuje od miesiąca poniesienia kosztów kwalifikowanych po decyzji o wsparciu, lecz wielkość dochodu wolnego od podatku w danym roku jest uzależniona od wysokości tych kosztów.

Zachowując względy formalne i materialne działalność magazynowa prowadzona przez wnioskodawcę w ramach inwestycji objętej decyzją o wsparciu stanowi działalność pomocniczą w rozumieniu Ustawy o CIT, co uzasadnia zastosowanie art. 17 ust. 6b, umożliwiając pełne zwolnienie dochodów z działalności realizowanej na obszarze określonym w decyzji.

Dochody uzyskiwane z działalności obejmującej dostawę, transport i montaż produktów mogą podlegać zwolnieniu z CIT, gdy stanowią jedną całość gospodarczą z działalnością objętą decyzją o wsparciu, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT. Usługi pomocnicze muszą być ściśle związane z działalnością główną określoną w decyzji.

Dochód uzyskany z komplementarnej działalności gospodarczej w ramach wspieranej inwestycji, proporcjonalnie do prawa do udziału w zysku i przypadającej części limitu wsparcia, może korzystać ze zwolnienia podatkowego zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 63b Ustawy PIT.

Brak możliwości wcześniejszego ustalenia wartości dostępnego zwolnienia podatkowego w ramach wsparcia udzielonego decyzjami o wsparciu inwestycji zwalnia podatnika z obowiązku kalkulacji i wpłaty zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych w trakcie roku podatkowego; obowiązki podatkowe określa się na termin złożenia zeznania rocznego.

Kary umowne wynikające z opóźnień czy niewykonania zobowiązań, niezależnie od winy, nie mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów zgodnie z art. 16 ust. 1 pkt 22 u.p.d.o.p., a tym samym nie podlegają alokacji kluczem przychodowym z art. 15 ust. 2 i 2a u.p.d.o.p.

Wydatki poniesione na budowę budynku, w tym przestrzeni biurowej związanej z działalnością produkcyjną określoną w decyzji o wsparciu, mogą być traktowane jako koszty kwalifikowane inwestycji, zwiększające limit pomocy publicznej, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o PDOP.

Po wyczerpaniu limitu pomocy publicznej z decyzji o wsparciu, spółka traci prawo do zwolnienia z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT i zyskuje prawo do wyboru ryczałtu od dochodów spółek, mimo że decyzja o wsparciu formalnie obowiązuje.

Dochody z działalności gospodarczej osiągnięte z realizacji nowej inwestycji wdrożonej zgodnie z decyzją o wsparciu, nawet jeśli obejmują elementy wyprodukowane przez kontrahentów pod nadzorem Spółki, mogą korzystać w całości ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, niezależnie od sposobu fakturowania elementów.

Dochody uzyskane z realizacji nowej inwestycji określonej w decyzji o wsparciu, które obejmują złożone produkty nabyte i opracowane przez Spółkę z wykorzystaniem zewnętrznych dostawców, mogą podlegać zwolnieniu z podatku dochodowego, o ile całość procesu produkcyjnego odbywa się w ramach nowej inwestycji na terenie określonym w decyzji. Sprzedaż tych produktów, jako całości funkcjonalnej, uprawnia

Przychody uzyskane z produkcji jednoskładnikowych form suchych suplementów diety w określonej lokalizacji, zgodnie z Decyzją o wsparciu, są zwolnione od podatku CIT na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, spełniając kryterium miejsca i nowej inwestycji.

Strata podatkowa powstała w wyniku działalności objętej decyzją o wsparciu, pomimo jej późniejszego wygaszenia, nie może być rozliczana z dochodami opodatkowanymi na zasadach ogólnych. Przychody i koszty związane z taką działalnością należy wyłączyć z dochodów stanowiących podstawę opodatkowania.

Dochody ze sprzedaży wyrobów gotowych, które po procesie produkcyjnym realizowanym u podwykonawców nie wracają do zakładu Spółki na etapy końcowe, nie mogą być w całości zwolnione z podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o PDOP.