Zwrotne koszty kwalifikowane na nowe inwestycje, które uzależniają prawo do zwolnienia podatkowego, muszą zostać faktycznie poniesione i ujawnione jako środki trwałe w ewidencji. Zwolnienie może być realizowane od momentu generowania dochodów z działalności powstałej na podstawie tych inwestycji, a nie wyłącznie na etapie ponoszenia kosztów.

Przychody i koszty związane z obrotem paletami, jako integralnymi elementami transportu wyrobów gotowych, mogą być kwalifikowane do dochodu objętego zwolnieniem z opodatkowania, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a Ustawy o CIT, jeśli pozostają w ścisłym związku z działalnością objętą wsparciem dla nowej inwestycji.

Wykorzystanie infrastruktury dofinansowanej z Kredytu Technologicznego nie ogranicza prawa do zwolnienia w ramach PSI, o ile koszty są rozłączne, a maksymalna wielkość pomocy publicznej nie zostaje przekroczona.

Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością, powstała z przekształcenia spółki jawnej, zachowuje prawo do stosowania zwolnienia z podatku dochodowego od osób prawnych (CIT) na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT w odniesieniu do dochodów uzyskanych z realizacji inwestycji, przy czym przekształcenie nie powoduje utraty tego uprawnienia.

Zwolnienie podatkowe na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT przysługuje od miesiąca poniesienia kosztów kwalifikowanych po decyzji o wsparciu, lecz wielkość dochodu wolnego od podatku w danym roku jest uzależniona od wysokości tych kosztów.

Zachowując względy formalne i materialne działalność magazynowa prowadzona przez wnioskodawcę w ramach inwestycji objętej decyzją o wsparciu stanowi działalność pomocniczą w rozumieniu Ustawy o CIT, co uzasadnia zastosowanie art. 17 ust. 6b, umożliwiając pełne zwolnienie dochodów z działalności realizowanej na obszarze określonym w decyzji.

Dochody uzyskiwane z działalności obejmującej dostawę, transport i montaż produktów mogą podlegać zwolnieniu z CIT, gdy stanowią jedną całość gospodarczą z działalnością objętą decyzją o wsparciu, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT. Usługi pomocnicze muszą być ściśle związane z działalnością główną określoną w decyzji.

Środki finansowe otrzymane od Ministerstwa Klimatu i Środowiska z tytułu zwrotu kosztów, stanowią przychód podatkowy, a koszty związane z niesprzedanymi towarami mogą być uznane jako bezpośredni koszt uzyskania przychodu w rozliczeniowym roku podatkowym, w którym przychód został uzyskany, z wyłączeniem możliwości ich ponownego zaliczenia w przyszłych okresach.

Dochody wspólnika spółki komandytowej z działalności mieszczącej się w decyzji o wsparciu zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 63b Ustawy PIT są zwolnione z podatku, proporcjonalnie do jego udziału w zyskach spółki, od momentu uzyskania wpływów ze sprzedaży pierwszych wyrobów wytworzonych lub usług świadczonych z użyciem środków trwałych nabytych w ramach wspartej inwestycji.

Dochód uzyskany z komplementarnej działalności gospodarczej w ramach wspieranej inwestycji, proporcjonalnie do prawa do udziału w zysku i przypadającej części limitu wsparcia, może korzystać ze zwolnienia podatkowego zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 63b Ustawy PIT.

Brak możliwości wcześniejszego ustalenia wartości dostępnego zwolnienia podatkowego w ramach wsparcia udzielonego decyzjami o wsparciu inwestycji zwalnia podatnika z obowiązku kalkulacji i wpłaty zaliczek na podatek dochodowy od osób prawnych w trakcie roku podatkowego; obowiązki podatkowe określa się na termin złożenia zeznania rocznego.

Kary umowne wynikające z opóźnień czy niewykonania zobowiązań, niezależnie od winy, nie mogą być zaliczone do kosztów uzyskania przychodów zgodnie z art. 16 ust. 1 pkt 22 u.p.d.o.p., a tym samym nie podlegają alokacji kluczem przychodowym z art. 15 ust. 2 i 2a u.p.d.o.p.

Wydatki poniesione na budowę budynku, w tym przestrzeni biurowej związanej z działalnością produkcyjną określoną w decyzji o wsparciu, mogą być traktowane jako koszty kwalifikowane inwestycji, zwiększające limit pomocy publicznej, zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o PDOP.

Po wyczerpaniu limitu pomocy publicznej z decyzji o wsparciu, spółka traci prawo do zwolnienia z art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT i zyskuje prawo do wyboru ryczałtu od dochodów spółek, mimo że decyzja o wsparciu formalnie obowiązuje.

Dochody z działalności gospodarczej osiągnięte z realizacji nowej inwestycji wdrożonej zgodnie z decyzją o wsparciu, nawet jeśli obejmują elementy wyprodukowane przez kontrahentów pod nadzorem Spółki, mogą korzystać w całości ze zwolnienia podatkowego na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, niezależnie od sposobu fakturowania elementów.

Dochody uzyskane z realizacji nowej inwestycji określonej w decyzji o wsparciu, które obejmują złożone produkty nabyte i opracowane przez Spółkę z wykorzystaniem zewnętrznych dostawców, mogą podlegać zwolnieniu z podatku dochodowego, o ile całość procesu produkcyjnego odbywa się w ramach nowej inwestycji na terenie określonym w decyzji. Sprzedaż tych produktów, jako całości funkcjonalnej, uprawnia

Przychody uzyskane z produkcji jednoskładnikowych form suchych suplementów diety w określonej lokalizacji, zgodnie z Decyzją o wsparciu, są zwolnione od podatku CIT na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o CIT, spełniając kryterium miejsca i nowej inwestycji.

Strata podatkowa powstała w wyniku działalności objętej decyzją o wsparciu, pomimo jej późniejszego wygaszenia, nie może być rozliczana z dochodami opodatkowanymi na zasadach ogólnych. Przychody i koszty związane z taką działalnością należy wyłączyć z dochodów stanowiących podstawę opodatkowania.

Dochody ze sprzedaży wyrobów gotowych, które po procesie produkcyjnym realizowanym u podwykonawców nie wracają do zakładu Spółki na etapy końcowe, nie mogą być w całości zwolnione z podatku dochodowego od osób prawnych na podstawie art. 17 ust. 1 pkt 34a ustawy o PDOP.

Pośrednie koszty uzyskania przychodów związane z działalnością zwolnioną z podatku, prowadzoną na podstawie decyzji o wsparciu, powinny zostać zaliczone do kosztów uzyskania przychodu w momencie uzyskania pierwszego przychodu z tej działalności, zgodnie z art. 15 Ustawy CIT.

Z dniem zakończenia inwestycji wskazanym w DOW, spółka nie jest zobowiązana do wpłacania zaliczek na podatek dochodowy z tytułu dochodu zwolnionego, a ulga B+R przysługuje do kosztów poniesionych przed tym dniem, z zastrzeżeniem braku ich uwzględnienia w dochodach zwolnionych.

Koszty wspólne, których nie można alokować bezpośrednio do źródeł przychodów, należy rozdzielać stosując klucz przychodowy, gdyż art. 15 ust. 2 i 2a updop stanowi o uniwersalnej i obligatoryjnej zasadzie proporcjonalnej alokacji kosztów pomiędzy działalność opodatkowaną a zwolnioną.

Prowadzenie przez przedsiębiorcę jednej, wspólnej ewidencji dla celów podatku dochodowego z działalności w SSE, z uwzględnieniem rozliczania pomocy publicznej zgodnie z kolejnością wydań zezwoleń i decyzji o wsparciu, stanowi rozwiązanie prawidłowe w świetle obowiązujących przepisów o specjalnych strefach ekonomicznych i wspieraniu nowych inwestycji.

Cena netto nabycia środków trwałych wykorzystywanych na podstawie leasingu finansowego, w tym opłaty wstępne, raty leasingowe oraz wartość końcowa, stanowią koszty kwalifikowane inwestycji na cele ulgi podatkowej, pod warunkiem spełnienia wszystkich kryteriów określonych w przepisach rachunkowych i Rozporządzeniu PSI.