Korekty wartości transakcji pomiędzy podmiotami powiązanymi, przeprowadzane po zakończeniu roku w ramach weryfikacji cen transferowych (outcome testing), mogą stanowić korekty cen transferowych, jeżeli spełniają warunki art. 11e ustawy CIT, w tym zapewnienie rynkowości transakcji i posiadanie stosownych dokumentów księgowych potwierdzających korektę.

Powiązania osobowe pomiędzy spółką a jednostką samorządu terytorialnego, wynikające z członkostwa osoby zatrudnionej w urzędzie gminy w organie nadzorczym spółki, wyłączają możliwość zastosowania zwolnienia z obowiązku sporządzania dokumentacji cen transferowych na podstawie art. 11n pkt 5 ustawy o CIT.

Transakcje kontrolowane obejmujące leki refundowane, gdzie cena wynika z przepisów ustaw refundacyjnych, są wyłączone spod przepisów Rozdziału 1a ustawy o CIT dotyczącego cen transferowych. Tym samym, ocena progów wartościowych nie uwzględnia wartości tych transakcji.

Spółki A Sp. z o.o. oraz B Spółka komandytowa nie stanowią podmiotów powiązanych w rozumieniu art. 11a ust. 1 pkt 4 ustawy o CIT, gdyż żaden podmiot ani osoba fizyczna nie wywiera znaczącego wpływu na obie spółki. Wskazane relacje nie generują obowiązku sporządzenia dokumentacji cen transferowych.

Transakcje dotyczące Leków refundowanych, dla których ceny ustalono na podstawie przepisów ustawy o refundacji, są wyłączone z obowiązku ujmowania w dokumentacji cen transferowych zgodnie z art. 11b pkt 1 ustawy o CIT.

Podmioty, które spełniają określone przesłanki braku korzystania ze zwolnień podatkowych oraz nieponoszenia strat podatkowych, mogą być zwolnione z obowiązku sporządzenia lokalnej dokumentacji cen transferowych dla krajowych transakcji kontrolowanych, zgodnie z art. 11n pkt 1 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.

Podmiot powiązany, mający siedzibę na terytorium Polski, spełniający warunki art. 11n ust. 1 ustawy o CIT, nie jest zobowiązany do sporządzania lokalnej dokumentacji cen transferowych, jeżeli nie korzysta ze zwolnień podatkowych i nie ponosi strat podatkowych.

W przypadku transakcji kontrolowanych między podmiotami powiązanymi mających siedzibę w Polsce, które nie korzystają z określonych zwolnień podatkowych i nie ponoszą strat, wyłączenie z obowiązku sporządzenia lokalnej dokumentacji cen transferowych w danym roku podatkowym, możliwe jest zgodnie z art. 11n pkt 1 ustawy o CIT.

Korekta dochodowości w wyniku weryfikacji cen transferowych (outcome testing) między podmiotami powiązanymi nie wpływa na podstawę opodatkowania VAT, a więc nie wymaga wystawiania faktur korygujących i jest dokumentowana innym dokumentem księgowym, jak nota księgowa.

Dotacje wynikające z modelu cen transferowych, mające na celu utrzymanie rentowności działalności, nie stanowią podstawy opodatkowania VAT, gdyż nie są wynagrodzeniem za skonkretyzowane świadczenia usług.

Dotacje, które funkcjonują jako korekty marży w ramach cen transferowych, nie są uznawane za czynności podlegające opodatkowaniu VAT, ponieważ nie stanowią wynagrodzenia za usługi świadczone przez beneficjenta, a są technicznym wyrównaniem poziomu rentowności transakcji między podmiotami powiązanymi.

Opłata Operacyjna stosowana do wyrównania rentowności między podmiotami powiązanymi stanowi korektę cen transferowych zgodnie z art. 11e ustawy o CIT, nie podlegającą opodatkowaniu zryczałtowanym podatkiem dochodowym w Polsce.

Obowiązek sporządzenia lokalnej dokumentacji cen transferowych dla transakcji kontrolowanej, w której powiązania wynikają wyłącznie z powiązań ze Skarbem Państwa lub jednostkami samorządu terytorialnego, podlega wyłączeniu zgodnie z art. 11n pkt 5 ustawy o CIT.

Leasing gruntu na oznaczony czas, przy spełnieniu warunków art. 17i Ustawy o CIT, wyłącza częściowo przychody i koszty z opłat leasingowych w podstawowym okresie tej umowy. Jednocześnie nie zwalnia z obowiązku sporządzenia dokumentacji cen transferowych.

Jeżeli jedna z powiązanych spółek poniosła stratę podatkową w źródle przychodów, do którego zalicza się daną transakcję kontrolowaną, obowiązek sporządzenia dokumentacji cen transferowych dotyczy wyłącznie transakcji z tym podmiotem. Zwolnienia wynikające z art. 11n pkt 1 ustawy o CIT nie obejmują tych transakcji.

Korekty cen wynikające z umów handlowych, które nie stanowią korekt cen transferowych ani nie są skutkiem błędów rachunkowych, mogą być rozliczane na bieżąco w podatku dochodowym od osób prawnych, zgodnie z art. 15 ust. 4i-4k CIT.

Zwolnienie z obowiązku sporządzania dokumentacji cen transferowych, przewidziane w art. 11n pkt 5 ustawy o CIT, nie ma zastosowania, jeżeli pomiędzy spółką a jej jedynym udziałowcem, jednostką samorządu terytorialnego, istnieją nie tylko powiązania kapitałowe, ale także powiązania osobowe związane z obecnością przedstawicieli gminy w organach spółki.

Transakcje między podmiotami powiązanymi uczestniczącymi w konsorcjum do przetargu nieograniczonego nie są zwolnione z obowiązku dokumentacji cen transferowych, mimo ustalenia ceny w trybie przetargu publicznego. Wartość przekraczająca 2 mln zł rocznie wymaga dokumentacji zgodnie z art. 11k ustawy o CIT.

Transakcja wykupu certyfikatów inwestycyjnych przez fundusz zamknięty od inwestora, której cena ustalana jest na podstawie UoFI, nie podlega przepisom Rozdziału 1a ustawy o CIT o cenach transferowych, wyłączając obowiązek dokumentacyjny, zgodnie z art. 11b pkt 1 CIT.

Status mikroprzedsiębiorcy lub małego przedsiębiorcy dla celów art. 11q ust. 3a pkt 1 ustawy o CIT ustala się wyłącznie na podstawie danych podatnika sporządzającego dokumentację cen transferowych, bez uwzględnienia danych podmiotów powiązanych. Jednocześnie, status powinien być określany na podstawie wyników z ostatniego roku podatkowego, wbrew stanowisku o wyłącznym odniesieniu do roku obowiązku

Korekta rentowności dotycząca wyrównania zakładanego poziomu marży nie stanowi świadczenia podlegającego opodatkowaniu VAT, nie wymaga więc wystawienia faktury VAT. Jest to czynność wyłączona z opodatkowania na gruncie ustawy o VAT.

Korekty cen transferowych (korekty dochodowości) realizowane między spółką a podmiotami zależnymi, mające na celu wyrównanie poziomu dochodowości do warunków rynkowych, nie podlegają opodatkowaniu VAT, gdyż nie stanowią odrębnej usługi ani nie odnoszą się do indywidualnych transakcji, lecz ogólnej działalności gospodarczej.

Korekty cen transferowych dokonane przez podatnika po zakończeniu roku podatkowego, w efekcie weryfikacji pierwotnie ustalonej ceny w transakcjach kontrolowanych, stanowią korekty cen transferowych w rozumieniu art. 11e ustawy o CIT, o ile spełnione są określone w nim warunki obejmujące zgłoszenie tej zmiany i potwierdzenie ich zgodności z warunkami rynkowymi.

Podmiot, w którym Skarb Państwa posiada pośrednio co najmniej 25% udziałów, jest zwolniony z obowiązku sporządzania lokalnej dokumentacji cen transferowych, z art. 11n pkt 5 ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych, nawet gdy powiązanie jest pośrednie.