W przypadku pomyłki w numerze NIP kontrahenta, podatnik jest zobowiązany do wystawienia faktury korygującej „do zera” i nowej faktury z poprawnym NIP; te dokumenty powinny być ujęte w ewidencji za okres, w którym powstał obowiązek podatkowy dla pierwotnej faktury, uwzględniając ograniczenia KSeF.
Dostawy towarów dokonywane przez podatnika poza terytorium Polski nie podlegają opodatkowaniu VAT w Polsce, o ile importer rozlicza VAT. Mimo to, transakcje te powinny być wykazywane w JPK_V7M, jeśli mogą wpływać na prawo do odliczenia VAT w Polsce.
Podatnik dokonujący nabycia towarów na terytorium Polski od dostawcy spoza UE, który nie posiada siedziby ani rejestracji VAT w Polsce, jest zobowiązany do rozliczenia podatku VAT jako podatnik, a transakcja powinna być wykazana w deklaracji JPK_V7M zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 5 ustawy o VAT.
Usługi związane z administracyjną obsługą biura, sklasyfikowane jako PKWiU 82.11.10.0, nie wymagają stosowania oznaczenia GTU_12 w ewidencji JPK_V7, gdyż nie stanowią usług doradczych ani zarządczych.
Podatnik jest zobowiązany do wystawienia faktury korygującej "do zera" oraz ponownie nowej faktury z prawidłowym NIP, ujmując te dokumenty w okresie, w którym powstała pierwotna obowiązek podatkowy; działanie to nie skutkuje powstaniem zaległości podatkowej.
Jeżeli faktura ustrukturyzowana zawiera błędny numer NIP, konieczne jest wystawienie faktury korygującej do zera oraz nowej faktury z prawidłowym NIP. Rozliczenie powinno nastąpić w okresie obowiązkowego podatkowego faktury pierwotnej.
Podatnik ma prawo odliczenia podatku VAT naliczonego z faktur zakupowych wystawionych przez dostawców w formie innej niż ustrukturyzowana (pap. lub elektroniczna), nawet wbrew obowiązkowi użycia KSeF, o ile spełnione są inne warunki uprawniające do odliczenia, zgodnie z art. 86 ust. 1 i przy braku negatywnych przesłanek z art. 88 ustawy VAT.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT naliczonego z faktur wystawionych poza KSeF, pod warunkiem spełnienia materialnych przesłanek odliczenia, a późniejsza strukturalna wysyłka przez KSeF nie wymaga korekty JPK_V7M.
W przypadku ewidencjonowania transakcji wewnątrzwspólnotowego nabycia towarów i importu usług należy stosować oznaczenie BFK, natomiast import towarów przez doskonalenie dokumentów celnych bez wykazywania podatku należnego w JPK wymaga oznaczenia DI.
Otrzymanie faktury VAT wystawionej poza KSeF nie pozbawia podatnika prawa do odliczenia podatku naliczonego, pod warunkiem spełnienia przesłanek materialnych, a przesłanie faktury ponownie przez KSeF nie wymaga korekty JPK_V7M.
Sprzedaż urządzeń pomiarowych - anemometrów oraz świadczenie usług związanych z ich przeglądami i naprawami, sklasyfikowane odpowiednio PKWiU 26.51.66.0 oraz 33.13.11.0, nie podlegają obowiązkowi oznaczenia kodem GTU w ewidencji JPK_V7M, ponieważ nie są objęte przez kody GTU_06 i GTU_12 zgodne z rozporządzeniem Ministra Finansów.
W systemie estońskiego CIT, przy raportowaniu JPK_ST_KR, obowiązkiem podatnika jest wpisanie poprawnych wartości zgodnych z wytycznymi rozporządzenia Ministra Finansów dla określonych pól, gdzie nie można uznać wypełnienia wszystkich pozycji jako nieistniejących lub zerowych.
Podatnik VAT ma prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur nieustrukturyzowanych, poza KSeF, o ile spełnione są warunki materialne do odliczenia i transakcje są rzeczywiste, bez wymogu korygowania JPK_V7M przy późniejszym wprowadzeniu faktury do KSeF.
Spółka przejmująca, nieprzekraczająca indywidualnego limitu przychodowego w roku poprzedzającym, nie jest zobowiązana do prowadzenia i przesyłania elektronicznych ksiąg rachunkowych na zasadach określonych w art. 9 ust. 1c ustawy o CIT z uwagi na przychody spółek przejmowanych jedynie, jeśli połączenie nastąpiło bez zamykania ksiąg rachunkowych.
Podatnikowi przysługuje prawo do odliczenia VAT naliczonego z faktur otrzymanych poza KSeF, które formalnie powinny być wystawione za jego pośrednictwem, o ile spełnione są inne warunki odliczenia, a późniejsze wprowadzenie faktury do KSeF nie wymaga korekty JPK_V7M.
Czynnemu podatnikowi VAT przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur zakupowych wystawionych poza KSeF, mimo obowiązku ich wystawienia w KSeF, o ile spełnione są inne warunki odliczenia. Późniejsze przesłanie faktury przez KSeF nie obliguje do korekty JPK_V7M.
Spółka może zaliczyć do kosztów uzyskania przychodów wydatki pracowników poniesione na delegacje, nawet jeśli dowody są wystawione imiennie na pracownika, a obowiązek JPK_KR_PD nie wymaga ujęcia takich pracowników w sekcji „Kontrahent”.
Przepisy ustawy o CIT, w kontekście art. 9 ust. 1c, nie nakładają obowiązku przesyłania ksiąg rachunkowych prowadzonych przez zagraniczne oddziały w postaci JPK_CIT, jeżeli te prowadzone są zgodnie z przepisami obowiązującymi w miejscu ich działalności. Obowiązek ten dotyczy jedynie ksiąg rachunkowych prowadzonych na podstawie polskiej ustawy o rachunkowości.
Spółka z ograniczoną odpowiedzialnością nie ma obowiązku przesyłania ksiąg rachunkowych prowadzonych przez jej samobilansujące się oddziały zagraniczne do polskiego organu podatkowego, zgodnie z art. 9 ust. 1c ustawy o CIT, gdyż obowiązek ten nie obejmuje ewidencji prowadzonej w innych jurysdykcjach według lokalnych przepisów.
Obowiązek przesyłania JPK_CIT nie ciąży na zagranicznych przedsiębiorcach prowadzących działalność poprzez zakład podatkowy w Polsce, jeśli nie posiadają oni oddziału ani przedstawicielstwa, a księgi rachunkowe prowadzone są za granicą, zgodnie z art. 9 ust. 1 i 4 ustawy o CIT.
Zarejestrowanemu podatnikowi podatku VAT przysługuje prawo do odliczenia podatku naliczonego z faktur wystawionych poza KSeF, mimo formalnego obowiązku korzystania z tego systemu, pod warunkiem spełnienia wszystkich pozostałych przesłanek odliczenia.
Eksport towarów przez polskiego podatnika do Wielkiej Brytanii, mimo posługiwania się brytyjskim numerem VAT, wymaga wystawiania faktur w KSeF oraz ujmowania transakcji w JPK_VAT jako sprzedaży eksportowej w Polsce.
Podatnicy opodatkowani ryczałtem od dochodów spółek, w celu ustalenia momentu, kiedy powstanie obowiązek przesyłania JPK_CIT, zobowiązani są do uwzględniania przychodów w rozumieniu ustawy o rachunkowości, a nie ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych.
Przemieszczenie maszyny budowlanej z jednego państwa członkowskiego UE do Polski, będącej własnością podatnika, stanowi nietransakcyjne wewnątrzwspólnotowe nabycie towarów, lecz podatnik powinien wykazywać siebie jako dostawcę w JPK_VAT i VAT-UE, uwzględniając obowiązek podatkowy zgodnie z art. 20 ustawy o VAT.