Koszty poniesione na podstawie faktur za usługi licencyjne, związane z działalnością spółki przekształconej, powinny być zaliczone w całości do kosztów uzyskania przychodów tej spółki z o.o., bez podziału na okresy działalności spółki jawnej i z o.o., zgodnie z zasadą sukcesji prawnej.

Ogół praw i obowiązków w spółce jawnej, jako składnik majątku osobistego według art. 33 pkt 5 Kodeksu rodzinnego i opiekuńczego, przy jego przeniesieniu na inną osobę generuje przychód z praw majątkowych, podlegający opodatkowaniu podatkiem dochodowym jako dochód nie wyłączony wymienionymi przepisami o podziale majątku wspólnego.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem w prostą spółkę akcyjną, już uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych, nie podlega ponownemu opodatkowaniu PIT w momencie wypłaty. Spółka nie jest zobowiązana do poboru zryczałtowanego podatku jako płatnik.

Wypłata zysków ("Stare zyski") przez spółkę komandytową, które zostały uprzednio opodatkowane podatkiem dochodowym od osób fizycznych w ramach działalności spółki jawnej, nie podlega ponownemu opodatkowaniu tym podatkiem po przekształceniu spółki w komandytową. W razie możliwej identyfikacji takich zysków, uznaje się je za neutralne podatkowo.

Zbycie nieruchomości I, III i IV w formie aportu do spółki jawnej stanowi odpłatną dostawę towarów podlegającą VAT, przy czym Nieruchomość III nie korzysta ze zwolnienia, będąc terenem budowlanym. Dla Nieruchomości I i IV zwolnienie przysługuje na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 10 ustawy o VAT.

Najem nieruchomości na podstawie umowy, ustalony na warunkach rynkowych, nie prowadzi do powstania dochodu z tytułu ukrytych zysków podlegającego opodatkowaniu ryczałtem zgodnie z art. 28m ustawy o CIT; czynsz ten wynika z uzasadnionych ekonomicznie i organizacyjnie działań potrzebnych do prowadzenia działalności gospodarczej.

Wypłaty zysków wypracowanych przez spółkę jawną przed jej przekształceniem i uprzednio opodatkowanych podatkiem dochodowym od osób fizycznych nie stanowią dochodu podlegającego opodatkowaniu ryczałtem od dochodów spółek zgodnie z art. 28m ustawy o CIT, gdyż nie spełniają definicji podzielonego zysku, ukrytych zysków ani innych kategorii dochodów opodatkowanych w omawianym systemie.

W przypadku uregulowania wierzytelności po zaprzestaniu prowadzenia działalności przez wspólnika, podatnik obowiązany jest zwiększyć podstawę obliczenia podatku w zeznaniu za rok, w którym nastąpiło uregulowanie, zgodnie z art. 26i ust. 7 ustawy o PIT, niezależnie od braku prowadzenia działalności w danym roku.

Wypłata zysków wypracowanych przez spółkę przekształconą, na podstawie uchwały podziału zysków, po przekształceniu w formę spółki kapitałowej, stanowi przychód z tytułu udziału w zyskach osób prawnych zgodnie z art. 17 ust. 1 pkt 4 ustawy o PIT i podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Zwrot nakładów poniesionych przez spółkę jawną w ramach działalności gospodarczej, zaliczanych uprzednio do kosztów uzyskania przychodu, stanowi przychód opodatkowany podatkiem dochodowym od osób fizycznych. Zwrot ten nie kwalifikuje się jako nieodpłatne świadczenie zwolnione z opodatkowania z art. 21 ust. 1 pkt 125 Ustawy PIT, gdyż spółka jawna nie spełnia kryterium przynależności do grupy podatkowej

W świetle art. 93a § 1 pkt 2 Ordynacji podatkowej przekształcona spółka z o.o. wstępuje we wszelkie prawa i obowiązki podatkowe przekształconej spółki jawnej, co uprawnia ją do zaliczenia do kosztów uzyskania przychodów wydatków poniesionych przed przekształceniem przez spółkę jawną, nawet jeśli te nie były uznane jako koszty przed tym dniem, pod warunkiem spełnienia odpowiednich przesłanek ustalonych

Odpłatne zbycie nieruchomości (lokalu mieszkalnego) wykorzystywanej w działalności gospodarczej spółki jawnej po upływie pięciu lat od jej nabycia nie powoduje uzyskania przychodu podatkowego w rozumieniu art. 10 ust. 1 pkt 8 ustawy o PIT.

Wniesienie nieruchomości jako wkładu do spółki jawnej przez osobę fizyczną, zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 50b ustawy o PIT, nie rodzi obowiązku podatkowego.

Spółka jawna, przekształcona ze spółki komandytowej, z dniem przekształcenia w spółkę jawną i zmiany składu wspólników na wyłącznie osoby fizyczne, przestaje być podatnikiem podatku dochodowego od osób prawnych.

Zwiększenie udziałów kapitałowych w spółce jawnej, wynikające z wniesienia aportu przez wspólników, nie stanowi darowizny podlegającej opodatkowaniu podatkiem od spadków i darowizn, gdyż operacja ta ma odpłatny i ekwiwalentny charakter, co wyklucza jej kwalifikację jako nieodpłatnego przysporzenia.

Spółka jawna, która uzyskała status podatnika CIT, nie traci tego statusu w wyniku zmiany składu wspólników na wyłącznie osoby fizyczne, i pozostaje zobowiązana do składania zeznań CIT-8 do czasu likwidacji lub wykreślenia z rejestru.

Nieodpłatne wycofanie zabudowanych nieruchomości ze spółki jawnej do majątku wspólników, przy nabyciu których odliczono VAT, stanowi czynność podlegającą opodatkowaniu podatkiem VAT jako odpłatna dostawa towarów. Natomiast wycofanie nieruchomości niezabudowanych, bez możliwości wcześniejszego odliczenia VAT, pozostaje neutralne na gruncie podatku VAT.

Przychód ze sprzedaży nieruchomości, użyczonej spółce jawnej, nabytej ponad pięć lat przed zbyciem, nie stanowi przychodu z działalności gospodarczej i nie podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Sprzedaż nieruchomości użyczonej spółce jawnej do działalności gospodarczej, która nie została wniesiona jako wkład do spółki, nie generuje przychodu z działalności gospodarczej, a przychód z jej zbycia, dokonany po upływie pięciu lat od nabycia, nie podlega opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych.

Aport wierzytelności do spółki jawnej oraz likwidacja spółki skutkująca otrzymaniem majątku w postaci nieruchomości i środków pieniężnych nie powodują powstania przychodu podatkowego po stronie wspólnika zgodnie z art. 21 ust. 1 pkt 50b oraz art. 14 ust. 2 i 3 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych.

Spółka jawna, której wspólnikami są wyłącznie osoby fizyczne, nie ponosi obowiązku płatnika podatku dochodowego od osób fizycznych z tytułu udziału w zyskach spółki. Obowiązek ten spoczywa na wspólnikach, którzy są osobami fizycznymi, dokonującymi rozliczenia podatkowego indywidualnie.

Sprzedaż nieruchomości przez wspólnika zlikwidowanej spółki jawnej przed upływem sześciu lat od ich wycofania z działalności gospodarczej stanowi przychód z pozarolniczej działalności gospodarczej, wykluczając w ten sposób możliwość skorzystania z ulgi mieszkaniowej określonej w art. 21 ust. 1 pkt 131 ustawy o PIT.

Przychód uzyskany z odpłatnego zbycia nieruchomości nabytych z likwidacji spółki jawnej, wykorzystywanych w działalności gospodarczej, stanowi przychód z pozarolniczej działalności gospodarczej, jeśli zbycie następuje przed upływem sześciu lat od wycofania z działalności. Brak możliwości zastosowania ulgi mieszkaniowej dla dochodów z odpłatnego zbycia nieruchomości.