Środki pieniężne przekazywane w celu realizacji zleceń nie stanowią przychodu podatkowego spółki pośredniczącej; jedynym przychodem jest prowizja za świadczone usługi, uznawana za trwałe przysporzenie majątkowe według ustawy o CIT.

Wynagrodzenie earn-out wypłacane w ramach Umowy Przedwstępnej, niezależne od ceny za akcje, stanowi koszt uzyskania przychodów inny niż bezpośrednio związany z przychodami, potrącalny w dacie poniesienia, a nie wydatek na nabycie akcji w rozumieniu wyłączeń z art. 16 ust. 1 pkt 8 ustawy o CIT.

W momencie sprzedaży nie w pełni zamortyzowanych środków trwałych, pełna wartość niezamortyzowana stanowi koszt uzyskania przychodu, niezależnie od części sfinansowanej dotacją. Nierozliczona wartość dotacji, wyksięgowana w związku ze sprzedażą, nie stanowi podatkowego przychodu do opodatkowania CIT.

Kwoty zapłacone tytułem kar umownych za nieterminowe, lecz prawidłowo jakościowo wykonane usługi przez podwykonawców mogą być uznane za koszty uzyskania przychodów, nie odnosząc się do art. 16 ust. 1 pkt 22 ustawy o CIT, pod warunkiem definitywności wydatku. Kary za wadliwe wykonanie usług wyklucza tenże artykuł z kategorii kosztów uzyskania przychodów.

Przychody z działalności związanej z pomocą techniczną opodatkowuje się 8,5% ryczałtem, zaś przychody z administrowania i konfiguracji systemów informatycznych 12% ryczałtem, pod warunkiem prawidłowej klasyfikacji usług zgodnie z PKWiU.

Prawo do odliczenia podatku naliczonego wynikającego z faktur, wystawionych i otrzymanych poza KSeF, nie jest wyłączone w sytuacji, gdy faktura spełnia formalne i materialne wymagania, niezależnie od późniejszego wystawienia jej w KSeF, pod warunkiem spełnienia pozostałych przesłanek uprawniających.