Postępowanie w sprawie nienależnie pobranego świadczenia jest dwuetapowe: wymaga wydania dwóch odrębnych decyzji administracyjnych dotyczących uznania świadczenia za nienależne oraz jego zwrotu. Ostateczna decyzja uznająca świadczenie za nienależne nie podlega dalszej ocenie przy decyzji o zwrocie.

Decyzja o zwrocie nienależnie pobranego świadczenia podlega wydaniu po uprzednim ustaleniu, że świadczenie zostało nienależnie pobrane; oba etapy wymagają odrębnych decyzji administracyjnych. Ostateczna decyzja o uznaniu świadczenia za nienależne wiąże postępowanie dotyczące jego zwrotu.

Przychody z tytułu świadczenia usług pomocowych w zakresie technologii informatycznych, obejmujących testowanie i konfigurację systemów, podlegają opodatkowaniu ryczałtem według stawki 8,5%, o ile usługi te nie dotyczą doradztwa informatycznego, które objęte są stawką 12%.

Usługi sportowe świadczone przez Fundację, która działa na rzecz rozwoju i upowszechniania sportu oraz nie jest nastawiona na zysk, mogą korzystać ze zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 32 ustawy, jeżeli usługi te mają ścisły związek z organizowaniem i uprawianiem sportu oraz są świadczone na rzecz osób uprawiających sport.

Wpłaty mieszkańców oraz dotacja dla gminy na budowę przydomowych oczyszczalni ścieków nie podlegają podatkowi VAT, gdyż nie stanowią one działalności gospodarczej w sensie ustawy o VAT, co wyklucza także prawo do odliczenia podatku naliczonego przez gminę.

Działania gminy dotyczące budowy przydomowych oczyszczalni ścieków, finansowane dofinansowaniem publicznym i wkładem własnym mieszkańców, nie stanowią działalności gospodarczej w rozumieniu art. 15 ust. 2 ustawy o VAT i nie są objęte opodatkowaniem podatkiem od towarów i usług.

Aport działów Sprzedaży Chemii, Serwisowego i Nieruchomości, ze względu na spełnienie kryteriów organizacyjnego, finansowego i funkcjonalnego wyodrębnienia, stanowi zbycie zorganizowanej części przedsiębiorstwa, co wyłącza te transakcje spod opodatkowania podatkiem VAT zgodnie z art. 6 pkt 1 ustawy o VAT.

Powiat realizując zadania publiczne w ramach programu nie działa jako podatnik VAT, zatem nie przysługuje mu prawo do odliczenia podatku naliczonego od poniesionych wydatków, gdyż nie mają one związku z czynnościami opodatkowanymi.

Infrastruktura rekreacyjna powstała w ramach inwestycji Gminy nie podlega opodatkowaniu VAT, a Gmina nie posiada prawa do odliczenia podatku naliczonego, z uwagi na jej wykorzystanie do celów niekomercyjnych, niezwiązanych z czynnościami opodatkowanymi.

Sprzedaż nieruchomości z obecnymi na niej cudzymi budowlami, przez gminę, nie kwalifikuje się do zwolnienia z podatku VAT na podstawie art. 43 ust. 1 pkt 9 ustawy o VAT, mimo klasyfikacji terenu jako niezabudowany w miejscowym planie zagospodarowania, i podlega podstawowej stawce 23% VAT.

Budowa przydomowych oczyszczalni ścieków przez gminę w ramach zadania niewykonywanego w celach zarobkowych oraz finansowanego głównie z dotacji publicznych, nie podlega opodatkowaniu podatkiem VAT, a wpłaty mieszkańców i dotacje celowe nie stanowią podstawy opodatkowania, co wyklucza prawo do odliczenia podatku VAT naliczonego przez gminę.