Odmowa wydania opinii o stosowaniu preferencji jest prawidłowa już wtedy, gdy organ podatkowy wykaże istnienie tylko uzasadnionych wątpliwości co do tego, że podatnik jest rzeczywistym właścicielem należności, bez konieczności definitywnego, stanowczego rekonstruowania prawdy materialnej w tym zakresie na takich zasadach, jak to się dzieje ściśle w postępowaniu podatkowym.
Przepisy art. 99 ust. 3-4 ustawy - Prawo farmaceutyczne podlegają bezpośredniemu zastosowaniu jedynie w postępowaniu w sprawie o udzielenie zezwolenia, o którym mowa w art. 99 ust. 1 tej ustawy, a nie w postępowaniu w sprawie zmiany tego rodzaju zezwolenia.
W sytuacji gdy strona dokonuje zmiany adresu do doręczeń, zawiadomienie o tej zmianie musi być dokonane w sposób niebudzący wątpliwości, co do jego adresata i etapu postępowania zgodnie z art. 146 § 1 Ordynacji podatkowej, w przeciwnym razie decyzja organu administracyjnego może być uznana za skutecznie doręczoną, a brak udziału strony w postępowaniu nie może być uznany za niezawiniony, co wyklucza
Nie każde wykroczenie proceduralne czy brak formalnego podpisania dokumentu przez stronę wpływa na stwierdzenie nieważności decyzji administracyjnej; rażące naruszenie prawa musi być oczywiste i tkwić w treści decyzji, a nie w przebiegu postępowania administracyjnego.