Zgodnie art. 18d ust. 1 ustawy o podatku dochodowym od osób fizycznych, korzystanie z ulgi badawczo-rozwojowej poprzez odliczenie kosztów kwalifikowanych od podstawy opodatkowania oraz z preferencyjnego opodatkowania dochodu z kwalifikowanych praw własności intelektualnej stawką IP BOX jest możliwe, gdy te mechanizmy nie prowadzą do dwukrotnego zaliczenia tych samych kosztów do przychodów.