Naczelny Sąd Administracyjny uznał, że zasadnym było uchylenie decyzji Samorządowego Kolegium Odwoławczego przez WSA w związku z koniecznością wyjaśnienia, czy ewidencja środków trwałych z 2018 r. była nowym dowodem w sensie art. 240 § 1 pkt 5 Ord. pod., uzasadniającym wznowienie postępowania.

Naczelny Sąd Administracyjny orzekł, że nieprawomocne uchylenie decyzji podatkowej przez sąd administracyjny nie wpływa na dalsze prowadzenie postępowania egzekucyjnego, nie wstrzymuje jego przebiegu ani rozpoznania zarzutów, co wymaga ponownego zbadania przez sąd administracyjny niższej instancji.

Członek zarządu, chcąc uwolnić się od odpowiedzialności za zaległości podatkowe spółki, musi wykazać brak swej winy w niezłożeniu wniosku o upadłość. Do wykazania przesłanki zwalniającej odpowiedzialność konieczne jest przedłożenie obiektywnych dowodów.

Odpowiednio do art. 88 ust. 3a pkt 4 lit. a ustawy o VAT, faktury stwierdzające niedokonane czynności nie dają prawa do odliczenia podatku naliczonego, nawet przy posiadaniu formalnie poprawnych dokumentów. Odliczenie wymaga dokumentowania rzeczywistego obrotu i zgodności zrealizowanych transakcji z fakturami.

Proporcjonalne odliczenie VAT przez gminę, w odniesieniu do działalności mieszanej, może być określone poprzez metodę powierzchniowo-czasową, uwzględniającą specyfikę działalności. NSA uznaje metodę odliczenia niezapisaną w rozporządzeniu za dopuszczalną, jeśli lepiej realizuje założenia VAT.

Odpowiedzialność członka zarządu za zaległości podatkowe spółki powstaje, gdy wykazana jest bezskuteczność egzekucji z majątku spółki, a przesłanki egzoneracyjne nie zostały wykazane.

Naczelny Sąd Administracyjny oddalił skargę kasacyjną, potwierdzając, że Agencja Mienia Wojskowego prowadzi działalność gospodarczą, a sporne nieruchomości są z nią związane, uzasadniając ich opodatkowanie według stawek najwyższych od działalności gospodarczej.

Opłata za gospodarowanie odpadami komunalnymi, ustalona na podstawie uchwały rady gminy, jest obligatoryjna i nie podlega indywidualnym negocjacjom w ramach decyzji administracyjnej. Zarzuty dotyczące metody jej ustalenia mogą być kwestionowane jedynie poprzez zaskarżenie uchwały do sądu administracyjnego.