W sprawach, których przedmiotem jest bezczynność organu nie można oceniać prawidłowości i zasadności wydania postanowienia o przedłużeniu terminu zwrotu różnicy podatku. Jest ono bowiem kontrolowane w odrębnym trybie, tzn. przysługuje na nie zażalenie, przewidziane w art. 274b w zw. z art. 277 Ordynacji podatkowej, a następnie skarga do sądu administracyjnego na podstawie art. 3 § 2 pkt 2 Prawa o postępowaniu