Metoda "prefinansowania (zaliczka) refinansowania" nie może bezpośrednio wpływać na to zwolnienie, podobnie jak i to, czy środki te pochodzą ze środków zgromadzonych na odpowiednim, rachunku bankowym.

Ustalenie, że dany podmiot - odmiennie niż wynika z faktury - nie był faktycznym sprzedawcą bądź usługodawcą skutkuje u podatnika (kupującego, usługobiorcy) wyłączeniem prawa do odliczenia przewidzianego w art. 19 ust. 1 ustawy o VAT z 1993 r.

Firma może pomniejszyć VAT, jeśli rzeczywiście kupiła towary lub usługi na potrzeby działalności. Transakcję potwierdza faktura, która musi odzwierciedlać rzeczywistość, inaczej podatnik nie ma prawa do odliczenia.

Niewątpliwie celem każdego postępowania odwoławczego jest powtórne rozpoznanie sprawy w jej pełnych granicach przedmiotowych, a nie tylko (czy też wyłącznie) weryfikacja poprawności rozstrzygnięcia pierwszoinstancyjnego, zaś celem postępowania wyjaśniającego przed organami administracji publicznej - zrekonstruowanie w sposób poprawny stanu faktycznego rozpoznawanej sprawy.

Dla powstania obowiązku odszkodowawczego niezbędne było spełnienie warunków odpowiedzialności wynikającej z tych przepisów, a w analizowanym przypadku - odpowiedzialności kontraktowej z art. 471 Kodeksu cywilnego. Wystarczająco odniósł się do tej kwestii Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie wywodząc, że wypłata świadczenia powinna wynikać ze zdarzenia, które rodziłoby odpowiedzialność kontraktową