Rażące naruszenie prawa, o którym mowa w art. 156 § 1 pkt 2 k.p.a., zachodzi jedynie w sytuacji, w której naruszenie to jest oczywiste, przepisy jasno określają wymagania, a skutki społeczne i ekonomiczno-gospodarcze tego naruszenia uniemożliwiają dalsze trwanie decyzji w obrocie prawnym.

Dla skorzystania z preferencyjnej stawki podatku dochodowego z tytułu kwalifikowanych praw własności intelektualnej (IP Box) podatnik jest zobowiązany do prowadzenia odrębnych ewidencji w sposób umożliwiający prawidłowe i terminowe ustalenie dochodów do opodatkowania preferencyjną stawką, co oznacza możliwość ich prowadzenia w sposób zapewniający złożenie prawidłowego zeznania podatkowego za dany rok

Jeżeli od budowli lub ich części nie dokonuje się odpisów amortyzacyjnych, niezależnie od prowadzenia ewidencji środków trwałych i formy prawnej podmiotu, należy jako podstawę opodatkowania podatkiem od nieruchomości przyjąć wartość rynkową określoną przez podatnika.

Postanowienie organu podatkowego o przedłużeniu terminu zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym ma samodzielny byt prawny i jest wydawane w odrębnej sprawie niż ta, dotycząca prawa do zwrotu podatku, jego wysokości oraz statusu podatnika VAT; w przypadku weryfikacji przez sąd administracyjny takiego postanowienia, kontrola ogranicza się do oceny, czy wskazano w sposób należyty istnienie wątpliwości

Stosowanie ulgi na działalność badawczo-rozwojową (B+R) oraz korzystanie z preferencyjnego opodatkowania dochodu z kwalifikowanych praw własności intelektualnej (preferencja IP Box) to odrębne instytucje prawa podatkowego, które mogą być stosowane niezależnie w stosunku do różnych dochodów. Ustawa o podatku dochodowym od osób prawnych nie zabrania odliczania kosztów kwalifikowanych w ramach ulgi B+

Dla skorzystania z preferencyjnej stawki (5%) przewidzianej dla dochodów z kwalifikowanych praw własności intelektualnej w rozumieniu art. 30ca u.p.d.o.f., podatnicy obowiązani są prowadzić odrębne ewidencje w sposób umożliwiający prawidłowe i terminowe ustalenie owych dochodów w celu złożenia stosownego zeznania podatkowego. Innymi słowy, bieżące prowadzenie odrębnej ewidencji w rozumieniu art. 30cb

Pełnomocnictwo udzielone w toku kontroli celno-skarbowej nie może być automatycznie stosowane w innym postępowaniu, np. dotyczącym przedłużenia terminu zwrotu podatku VAT, bez formalnego złożenia go w akcie danej sprawy.