W świetle art. 138 § 2 kodeksu postępowania administracyjnego, organ odwoławczy ma prawo uchylić decyzję w całości i przekazać sprawę do ponownego rozpatrzenia przez organ pierwszej instancji, gdy decyzja została wydana z naruszeniem przepisów postępowania mających istotny wpływ na jej rozstrzygnięcie.
Na podstawie art. 84 ust. 3 ustawy o ochronie przyrody, odstępstwo od warunków zezwolenia na usunięcie drzew i dokonanie nasadzeń zastępczych w sposób inny niż przewiduje zezwolenie, bez wcześniejszego uzyskania zmiany decyzji w tym zakresie, nie może być samodzielnie oceniane przez stronę jako spełnienie obowiązków nałożonych zezwoleniem.
W przypadku ustalania obowiązku partycypacji w kosztach utrzymania urządzeń wodnych, organ administracyjny powinien dokonać oceny, czy i w jakim zakresie poszczególne podmioty odnoszą korzyści z funkcjonowania tych urządzeń, zgodnie z zasadami określonymi w przepisach prawa wodnego, co wymaga uwzględnienia konkretnych okoliczności sprawy.
Zgodnie z art. 80 ust. 2 ustawy środowiskowej, sprzeczność planowanego przedsięwzięcia z ustaleniami miejscowego planu zagospodarowania przestrzennego stanowi wystarczającą przesłankę do odmowy ustalenia środowiskowych uwarunkowań realizacji przedsięwzięcia.