Podatnik nie ma prawa do pełnego odliczenia podatku naliczonego w ramach działalności mieszanej, jeżeli wydatki nie były bezpośrednio i w całości przyporządkowane do wykonania czynności opodatkowanych, a sankcja za niewłaściwe odliczenie podatku naliczonego może być zastosowana także w przypadku nieprawidłowości nie mających charakteru oszustwa podatkowego, lecz prowadzących do nieuzasadnionego uszczuplenia

Zasada prawdy obiektywnej w postępowaniu podatkowym zobowiązuje organy podatkowe do gromadzenia i uzupełniania materiału dowodowego tylko do momentu uzyskania pewności co do stanu faktycznego sprawy, natomiast obowiązek ten nie jest nieograniczony i nie zawsze uzasadnia niezbędność przeprowadzenia wszystkich wnioskowanych przez strony dowodów.