Zastosowanie art. 24 ust. 3 ustawy SENT wymaga wykazania przez stronę spełnienia przesłanek ważnego interesu przewoźnika lub interesu publicznego, które muszą być rozpatrywane w odniesieniu do celów ustawy SENT oraz szczegółowego stanu faktycznego danej sprawy.

W zakresie odstąpienia od granicznych wielkości emisyjnych dla zanieczyszczeń, organy administracyjne mogą stosować średnie ważone w sytuacji, gdy mieszane są różne strumienie ścieków objęte różnymi normami, pod warunkiem, że nie zostaną przekroczone standardy emisyjne, a odstępstwo zostanie udzielone zgodnie z przesłankami artykułu 204 ust. 1 i 2 ustawy Prawo ochrony środowiska oraz przepisami dyrektywy

Naczelny Sąd Administracyjny uznał, że organ odwoławczy ma prawo uchylić decyzję pierwszej instancji i przekazać sprawę do ponownego rozpatrzenia, jeżeli w toku postępowania wystąpiły uchybienia mające istotny wpływ na rozstrzygnięcie, a przeprowadzenie dodatkowego postępowania wyjaśniającego jest konieczne.