W tym stanie faktycznym sąd stwierdził, że skarga kasacyjna nie zasługuje na uwzględnienie, z uwagi na brak wystarczających podstaw. Żaden z podniesionych w skardze zarzutów nie zasługuje na uwzględnienie, w tym brak: rachunku uproszczonego nr 5/0/98, postępowania dowodowego na okoliczność poniesienia oraz że IS wydała decyzję z naruszeniem art. 200 § 1 Op.

W sytuacji, gdy o powstaniu nadpłaty decyduje wynik odrębnie rozstrzygniętych spraw mających za przedmiot inne, aniżeli objęte danym postępowaniem, okresy rozliczeniowe fakty wynikające z nich ujawniają się ze skutkiem dla innych postępowań dopiero w dacie ich podjęcia a nie w dacie, w której z mocy art. 74 par. 1 ustawy z dnia 29 sierpnia 1997 r. - Ordynacja podatkowa - Dz.U. nr 137 poz. 926 ze zm

Skoro organy podatkowe mają prawo określenia zobowiązania podatkowego w innej wysokości niż to uczynił podatnik, to nie oznacza to, że organ podatkowy musi uwzględniać do odliczenia podatek naliczony zawarty w fakturach ujętych w deklaracjach skoro deklaracje, nie zostały złożone przed rozpoczęciem kontroli.